如何在Bash中重命名多文件：调整名称结构并添加前置序号

没问题，我来帮你搞定这个批量重命名的需求！先理清楚核心目标：把原文件名里的样本名、任务ID、染色体编号三个字段调整顺序，同时给每个文件加上连续的有序编号（用三位数字格式化，避免排序混乱）。

先明确原文件名结构 #

从你的示例来看，原文件名的固定格式是：
[样本名（可含下划线，比如CSC0832_1）]_[任务ID（1-12的数字）]_[染色体编号（chrI至chrXXI）].vcf

举两个对应例子：

• 8116_1_chrI.vcf → 样本名8116、任务ID1、染色体chrI
• CSC0832_1_7_chrVIII.vcf → 样本名CSC0832_1、任务ID7、染色体chrVIII

实现步骤 #

我们可以用Bash循环配合正则表达式拆分字段，再重新组合成新文件名，全程在终端就能完成。

1. 先预览重命名效果（安全测试）

先执行下面的命令，不会实际修改文件，只会打印出将要执行的重命名操作，确认结果符合预期后再执行实际重命名：

count=1
for file in *.vcf; do
    # 用正则拆分出样本名、任务ID、染色体编号
    read sample task chr <<< $(echo "$file" | sed -E 's/(.*)_([0-9]{1,2})_(chr.*)\.vcf/\1 \2 \3/')
    # 生成新文件名：有序编号_任务ID_样本名_染色体编号.vcf（编号用三位数字格式化）
    new_file=$(printf "%03d_%s_%s_%s.vcf" $count $task $sample $chr)
    echo "准备重命名：$file → $new_file"
    ((count++))
done

2. 执行实际重命名

如果预览结果没问题，把上面的echo "准备重命名：..."替换成mv "$file" "$new_file"即可：

count=1
for file in *.vcf; do
    read sample task chr <<< $(echo "$file" | sed -E 's/(.*)_([0-9]{1,2})_(chr.*)\.vcf/\1 \2 \3/')
    new_file=$(printf "%03d_%s_%s_%s.vcf" $count $task $sample $chr)
    mv "$file" "$new_file"
    ((count++))
done

自定义调整 #

如果你想修改字段的排列顺序，只需要调整printf里的参数顺序就行：
比如想要有序编号_样本名_任务ID_染色体编号.vcf的格式，就把printf改成：

new_file=$(printf "%03d_%s_%s_%s.vcf" $count $sample $task $chr)

关键细节说明 #

• 用printf "%03d"生成三位数字编号：这样编号是001、002...010，而非1、2...10，避免后续排序时出现1、10、11...2的混乱。
• 正则表达式(.*)_([0-9]{1,2})_(chr.*)\.vcf：专门匹配最后一个数字段（任务ID，1-12是1或2位数字），确保样本名里的下划线不会被误拆分。
• 变量用双引号包裹：避免文件名中出现空格（虽然你的示例里没有，但这是Bash脚本的通用好习惯）。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Rachel