USB拇指驱动器无报错但文件复制内容不一致的问题求助

大家好，我遇到一个挺棘手的问题，想请各位帮忙分析下：

我最近检查全系统数据的USB备份时，发现有两个拇指驱动器里的备份内容和原数据对不上，但整个复制过程完全没有报错提示。对比下来，有好几份文件和原版都存在内容差异。

我做了一系列排查步骤来确认问题：

• 先用sha1sum给原文件和备份文件生成校验和，随机抽测了几个文件，结果校验值全对不上
• 接着用diff工具对比，证实文件内容确实不一致
• 又用cmp工具验证，它不仅确认了差异存在，还给出了第一处内容差异的偏移位置
• 之后用hexedit做可视化对比，发现有的文件只是差了一两个字节，有的差异范围更大
• 我还挑了备份里的一个zip文件做进一步测试，结果打开时直接提示文件损坏，坐实了备份内容出错的问题

补充下复制方式：这些文件是通过Shell脚本执行cp -r xxx .命令复制到USB拇指驱动器的，脚本是在命令行环境下运行的。

备注：内容来源于stack exchange，提问作者thing1