先看看你遇到的错误日志：

I0329 20:38:56.742496 13649 layer_factory.hpp:77] 创建layer data
[libprotobuf FATAL google/protobuf/stubs/common.cc:61] 本程序需要Protocol Buffer运行时库3.5.0版本，但已安装版本为2.6.1。请更新您的库。如果您自行编译程序，请确保头文件与链接时使用的Protocol Buffers版本一致。（版本验证在"google/protobuf/descriptor.pb.cc"中失败。）
terminate called after thro...

这个问题我之前帮不少开发者排查过，核心就是Protocol Buffer（简称protobuf）的编译版本和运行时版本不匹配——Caffe编译时依赖的是3.5.0，但是系统当前加载的是旧的2.6.1版本，导致运行时校验失败直接崩溃。下面给你两种靠谱的解决思路：

思路一：更新系统全局的protobuf到3.5.0版本 #

如果你的系统没有其他依赖旧版本protobuf的程序，直接替换是最省心的：

• 先卸载旧版本的protobuf开发包和编译器：

  sudo apt-get remove libprotobuf-dev protobuf-compiler
  

• 下载并手动编译3.5.0版本（源码编译能保证版本精准）：

  wget https://github.com/protocolbuffers/protobuf/releases/download/v3.5.0/protobuf-all-3.5.0.tar.gz
  tar zxf protobuf-all-3.5.0.tar.gz
  cd protobuf-all-3.5.0
  ./configure --prefix=/usr/local
  make -j$(nproc)  # 用所有CPU核心加速编译
  sudo make install
  sudo ldconfig  # 更新系统库缓存
  

• 验证版本是否生效：

  protoc --version
  

  正常会输出libprotoc 3.5.0

思路二：重新编译Caffe，指定链接正确的protobuf版本 #

如果系统里还有其他程序依赖旧版protobuf，不想替换全局版本，可以让Caffe单独使用3.5.0：

• 打开Caffe根目录下的Makefile.config，找到INCLUDE_DIRS和LIBRARY_DIRS配置，添加手动编译的3.5.0版本的路径（假设你把protobuf装在了/usr/local）：

  INCLUDE_DIRS += /usr/local/include
  LIBRARY_DIRS += /usr/local/lib
  

• 清理旧的编译产物，重新编译Caffe：

  make clean
  make -j$(nproc)
  make pycaffe  # 如果需要Python接口的话执行这一步
  

额外要注意的坑 #

• 如果你用Anaconda虚拟环境，一定要检查环境内的protobuf版本：

  conda list protobuf
  

  如果版本不是3.5.0，用conda install protobuf=3.5.0安装对应版本，避免和系统全局版本冲突
• 编译完成后，可以用ldd /path/to/your/caffe/build/libcaffe.so查看Caffe链接的protobuf库路径，确认是3.5.0版本的文件，这样能提前规避运行时的问题

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Huangxs