首先，你遇到的问题核心是用错了SQLAlchemy的数据库方言：mssql+pyodbc是专门为Microsoft SQL Server设计的，而你连接的是InterSystems的ODBC数据源，两者的数据库系统逻辑、语法兼容度不同，导致连接或执行SQL时出错。

下面是两种可行的解决方案：

方案一：使用InterSystems专用的SQLAlchemy方言 #

InterSystems的IRIS（及旧版Cache）有社区维护的SQLAlchemy方言包，能更好地适配其数据库特性：

1. 安装适配你SQLAlchemy 1.2.5版本的方言包：

   pip install sqlalchemy-intersystems-iris==1.0.0  # 选择支持SQLAlchemy 1.2.x的版本
   

2. 修改连接字符串，使用专用方言：

   from sqlalchemy import create_engine
   import pyodbc
   
   # 针对IRIS用iris+pyodbc方言，旧版Cache可尝试cache+pyodbc
   engine = create_engine("iris+pyodbc://user:pass@mydsn", echo=True)
   cnxn = engine.connect()
   # 复用你之前pyodbc能正常执行的SQL即可
   rows = cnxn.execute("SELECT name FROM sys.tables").fetchall()
   print(rows)
   

方案二：使用通用ODBC方言（无需额外安装包） #

如果不想安装专用方言，可以用SQLAlchemy的通用ODBC连接方式，绕过SQL Server特有的逻辑：

1. 修改连接字符串为通用ODBC格式：

   from sqlalchemy import create_engine
   import pyodbc
   
   # 用odbc+pyodbc作为通用方言，直接指定DSN
   engine = create_engine("odbc+pyodbc://user:pass@mydsn", echo=True)
   # 若DSN配置有问题，可显式指定驱动：
   # engine = create_engine("odbc+pyodbc://user:pass@?driver=InterSystems+ODBC&dsn=mydsn")
   cnxn = engine.connect()
   rows = cnxn.execute("SELECT name FROM sys.tables").fetchall()
   print(rows)
   

额外注意点 #

• 确认SELECT name FROM sys.tables在你的InterSystems数据库中有效：如果pyodbc能正常执行就没问题；如果不行，可能需要替换为InterSystems对应的系统查询，比如查询持久化表可以用SELECT Name FROM %Dictionary.ClassDefinition WHERE Super='%Persistent'。
• 检查版本兼容：你的Python3.6.4建议搭配pyodbc 3.x版本，确保和SQLAlchemy 1.2.5适配。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Maki