相同C++代码：g++编译与Rcpp调用为何速度差近4倍？

这个问题其实挺常见的，核心原因大概率不是编译器本身不同，而是编译优化参数和链接配置的差异在搞鬼，我给你拆解几个最可能的点：

• 编译优化等级是头号嫌疑
  Rcpp在编译C代码时，默认就开启了较高的优化级别（通常是-O2甚至-O3），还可能加上针对你本地CPU的专属优化参数比如-march=native，让代码充分利用你机器的硬件特性。但如果你直接用g++ yourcode.cpp编译，默认是-O0级别——这是为调试准备的，几乎没做任何性能优化，代码运行起来自然慢一大截。
  你可以试试给g加上和Rcpp一致的优化参数再编译，比如：

  g++ -O3 -march=native yourcode.cpp -lnlopt -o test
  

  再运行对比，速度应该会大幅提升，甚至和Rcpp调用的版本持平。

• 链接的库版本/方式可能有差异
  你用到了nlopt优化库，Rcpp调用时可能链接的是R环境里预编译好的、经过优化的nlopt版本，甚至是静态链接；而你直接编译时可能动态链接了系统默认的nlopt库，那个库可能没做过优化，或者动态链接带来了额外的运行开销。你可以检查R里nlopt的链接配置，再对应调整g++的链接参数。

• 编译器本身？可能性极小
  除非你手动给R配置了不同的编译器（比如clang而非系统默认的g++），否则Rcpp默认用的就是你系统里的g++。所以核心差异不在编译器，而在编译时的参数设置。

验证方法 #

你可以在R里查看Rcpp的编译参数，运行以下命令：

Sys.getenv("PKG_CXXFLAGS")
Sys.getenv("PKG_LIBS")

把输出的参数原封不动加到你的g++编译命令里，再运行一次，应该就能看到速度差异消失了。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者David Zarruk Valencia