Mac OS Sierra 10.12.6下无法安装adespatial包的技术咨询

为什么没有二进制包可用？ #

主要有两个核心原因：

• 你的R版本3.1.2实在太老了（发布于2014年），CRAN上绝大多数包的二进制版本只针对较新的R版本（通常至少是3.5.x及以上），旧版本R完全不在官方支持范围内。
• 你的Mac OS Sierra 10.12.6也属于偏旧的系统，CRAN的二进制包一般只适配当前主流或较新的Mac系统版本，旧系统自然没有对应的预编译二进制包。

所以只能通过源码编译安装来解决这个问题，下面是具体步骤：

步骤1：安装编译工具 #

Mac上编译R包需要Xcode命令行工具，打开终端执行：

xcode-select --install

按照弹出的提示完成安装即可，这是源码编译的基础。

步骤2：提前安装依赖包 #

adespatial依赖不少其他R包，先把这些依赖装好能避免后续安装报错。在RStudio里执行：

install.packages(c("vegan", "ade4", "sp", "igraph", "permute", "labdsv", "ape", "adegraphics"), type = "source")

如果某个依赖包安装失败，可能需要找适配R3.1.2的旧版本，这时候可以用旧版本的devtools来安装指定版本的包：

1. 先安装适配R3.1.2的devtools版本（1.13.6是最后支持R3.1.x的版本）：

install.packages("devtools", type = "source")

2. 然后用devtools::install_version()安装指定版本的依赖，比如假设vegan需要2.4-2版本：

library(devtools)
install_version("vegan", version = "2.4-2")

步骤3：安装adespatial源码包 #

所有依赖搞定后，执行下面的命令安装adespatial：

install.packages("adespatial", type = "source")

额外建议：升级R版本（更省心的方案） #

R3.1.2已经过时太久了，很多新功能、新包都不支持，后续还会遇到更多类似的安装问题。你的Mac Sierra 10.12.6可以升级到R3.6.3（这是支持Mac 10.12的最后一个R版本），升级后很多包都能直接安装二进制版本，不用再折腾源码编译。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Alex Zalmat