首先得明确一个关键事实：.NET Framework是Windows专属的框架，它的exe安装包没法在CentOS这类Linux系统上运行，而且.NET Core环境也不会包含.NET Framework的引用程序集——这就是你遇到The reference assemblies for framework ".NETFramework, Version=v4.6.1" were not found错误的核心原因。

下面给你几个可行的解决方案，按推荐优先级排序：

1. 迁移项目到.NET Core/.NET 5+（最优解） #

这是长远来看最靠谱的方案，因为.NET Core（现在已经统一为.NET 5及以后版本）是跨平台的，完全适配Linux环境，而且微软现在的主力维护方向也是.NET而非旧的.NET Framework。

具体步骤：

• 排查Windows专属依赖：先检查你的项目是否用到了.NET Framework独有的API，比如System.Windows.Forms、System.Web、Windows注册表操作、WPF这类。如果有，需要替换成跨平台替代方案：
  • Web应用：换成ASP.NET Core
  • 桌面应用：考虑用MAUI、Avalonia这类跨平台UI框架
  • 系统操作：用System.IO、System.Diagnostics里的跨平台方法替代Windows特定调用
• 转换项目文件为SDK风格：旧的.NET Framework项目用的是非SDK格式的.csproj，需要改成现代SDK风格。比如把原来的项目内容替换成：

  <Project Sdk="Microsoft.NET.Sdk">
    <PropertyGroup>
      <!-- 替换成你CentOS上安装的.NET版本，比如net6.0、net7.0 -->
      <TargetFramework>net6.0</TargetFramework>
      <!-- 如果需要保留Windows上的.NET Framework兼容性，可以用多目标框架 -->
      <!-- <TargetFrameworks>net461;net6.0</TargetFrameworks> -->
    </PropertyGroup>
    <!-- 原来的项目引用、NuGet包引用可以保留，之后更新兼容的版本 -->
  </Project>
  

• 更新NuGet依赖：打开项目后，用NuGet更新所有包到支持.NET Core/.NET的版本，移除那些只支持.NET Framework的包。
• 测试运行：在CentOS上，如果你用了多目标框架，运行时指定跨平台的目标：

  dotnet run --project foldername --framework net6.0
  

  如果是单一目标，直接用dotnet run --project foldername即可。

2. 用Mono运行.NET Framework应用（临时过渡方案） #

如果暂时没法迁移项目，可以试试Mono——这是一个跨平台的.NET Framework兼容实现，能在Linux上运行大部分.NET Framework应用。

安装和运行步骤：

• 在CentOS上安装Mono：

  # 导入Mono的GPG密钥
  sudo rpm --import https://download.mono-project.com/repo/xamarin.gpg
  # 添加Mono的CentOS仓库（以CentOS 7为例，其他版本请对应调整）
  sudo curl -o /etc/yum.repos.d/mono-centos7.repo https://download.mono-project.com/repo/centos7-stable.repo
  # 安装完整的Mono套件
  sudo yum install mono-complete
  

• 运行你的应用：先在Windows上编译出.NET Framework 4.6.1的exe文件，上传到CentOS后，用Mono执行：

  mono YourApp.exe
  

  注意：Mono对部分.NET Framework的API支持可能不完全，尤其是一些Windows深度绑定的功能（比如WCF的某些特性），需要充分测试。

3. 条件编译适配跨平台（小改动场景） #

如果你的项目只有少量Windows专属代码，可以用条件编译指令区分不同框架的实现：

#if NETFRAMEWORK
// .NET Framework下的Windows特定代码
using Microsoft.Win32;
var key = Registry.CurrentUser.OpenSubKey("SomeKey");
#else
// .NET Core/.NET下的跨平台替代代码
var configPath = Path.Combine(Environment.GetFolderPath(Environment.SpecialFolder.UserProfile), ".yourapp", "config.json");
#endif

这种方法适合改动量小的项目，配合多目标框架使用，既能保留Windows上的原有功能，又能在CentOS上正常运行。

最后提醒：部署到CentOS时，推荐用dotnet publish生成部署包，比如生成自包含部署包（不需要服务器提前装.NET）：

dotnet publish foldername -c Release -r linux-x64 --self-contained true

这样生成的包可以直接在CentOS上运行，不需要额外安装.NET环境。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者HDev