这个问题其实挺常见的——你在全局.Rprofile里设置的setwd()之所以对RStudio的Projects文件选择器没用，核心原因是RStudio的项目选择器是在R会话启动之前就加载的，这时候你的.Rprofile还没被执行，自然没法影响文件选择器的初始路径。

针对你的环境（R 3.4.4、RStudio 1.1.442、Ubuntu 16.04），这里有几个可行的解决方案：

1. 修改RStudio的全局默认工作目录配置 #

RStudio的文件选择器默认路径存在它独立的配置文件里，和R的.Rprofile是分开的：

• 打开终端，编辑RStudio的偏好设置文件：

  nano ~/.config/rstudio/rstudio-prefs.json
  

• 在这个JSON文件里，找到（如果没有就手动添加）default-working-directory键，把它的值改成你想要的路径，比如：

  "default-working-directory": "~/my project base dir"
  

• 保存文件后，完全重启RStudio（不是只重启R会话），再打开Projects菜单的文件选择器，就会默认定位到你设置的目录了。

2. 针对单个项目设置工作目录 #

如果只是想让某个特定项目启动时自动切换到目标目录，可以在项目的根目录下创建一个本地.Rprofile文件，里面写入：

setwd("~/my project base dir")

这样每次打开这个项目时，R会话启动后就会自动执行这条命令切换目录。不过这个方法只对该项目生效，适合有特殊路径需求的单个项目。

3. 快速访问常用目录的小技巧 #

如果你只是想快速跳转到目标目录，不用改配置的话，可以在RStudio的「Files」面板里，找到你常用的目录，右键选择「Add to Favorites」，之后不管打开哪个项目，都能在「Files」面板的「Favorites」里一键跳转到该目录，非常灵活。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Dan Reznik