CentOS 6 64位下rgdal安装失败求助：libgdal.so.20找不到问题

从你贴的安装日志来看，核心问题很明确：GDAL 2.2.3已经装好了，但系统的动态链接库加载器找不到libgdal.so.20——这是因为CentOS 6默认不会把/usr/local/lib（GDAL的默认安装路径）加入动态库搜索路径，导致编译rgdal时依赖找不到。

下面给你分步解决的方案：

临时修复（立即生效，重启后失效） #

先在RStudio-Server控制台里执行这行命令，临时把GDAL的库路径加入环境变量：

Sys.setenv(LD_LIBRARY_PATH="/usr/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH")

然后重新运行安装命令：

install.packages("rgdal")

永久修复（重启后依然有效） #

如果临时方法能解决，建议做永久配置，省得每次都要手动设置：

方法1：通过系统动态库配置文件添加 #

1. 创建GDAL的库路径配置文件：

echo "/usr/local/lib" | sudo tee /etc/ld.so.conf.d/gdal.conf

2. 更新系统动态库缓存：

sudo ldconfig

3. 重启RStudio-Server后再安装rgdal就没问题了。

方法2：通过用户环境变量配置（无sudo权限时用） #

如果你没有管理员权限，可以修改自己的bash配置：

1. 打开~/.bashrc或者~/.bash_profile文件：

vi ~/.bashrc

2. 在文件末尾添加一行：

export LD_LIBRARY_PATH="/usr/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH"

3. 让配置立即生效：

source ~/.bashrc

4. 重启RStudio-Server后重新安装rgdal即可。

额外方案：强制指定GDAL路径安装 #

如果上面的方法还是不生效，可以在安装rgdal时直接指定GDAL的所有相关路径，确保编译时能精准找到依赖：

install.packages("rgdal", 
                 configure.args = c("--with-gdal-config=/usr/local/bin/gdal-config",
                                    "--with-proj-include=/usr/local/include",
                                    "--with-proj-lib=/usr/local/lib"))

附你提供的安装日志：

install.packages("rgdal")
正在将软件包安装至‘/home/admin/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.4’（因未指定‘lib’）
尝试URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/rgdal_1.2-18.tar.gz'
内容类型'application/x-gzip'，大小1650578字节（1.6 MB） #

已下载1.6 MB

• 正在安装源码包‘rgdal’...
  ** 软件包‘rgdal’已正确解压且MD5校验通过
  configure: CC: gcc -m64 -std=gnu99
  configure: CXX: g++ -m64
  configure: rgdal: 1.2-18
  checking for /usr/bin/svnversion... yes
  configure: svn revision: 718
  checking for gdal-config... /usr/local/bin/gdal-config
  checking gdal-config usability... yes
  configure: GDAL: 2.2.3
  checking GDAL version >= 1.6.3... yes
  checking gdal: linking with --libs only... yes
  checking GDAL: /usr/local/share/gdal/pcs.csv readable... yes
  configure: -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m64 -mtune=generic -fpic -fPIC -I/usr/local/include
  checking proj_api.h presence and usability... yes
  ./proj_conf_test1: error while loading shared libraries: libgdal.so.20: cannot open shared object file: No such file or directory
  checking PROJ.4 version...

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Saber bouabid