我之前也碰到过一模一样的问题！PyCharm的内置IPython Notebook并不依赖系统级的IPython配置（也就是你修改的~/.ipython/profile_default/static/custom路径下的文件），它有自己独立的静态资源目录，所以你之前的修改不会生效。下面是具体的解决步骤：

步骤1：定位PyCharm内置Notebook的CSS路径 #

在Linux Mint下，根据你的PyCharm安装方式，路径会略有不同：

• 官方安装包/手动解压版：通常路径是 /opt/pycharm-<你的版本号>/plugins/python/helpers/pydev/pydev_ipython/static/custom
  比如你用的是PyCharm 2024.1，路径就是 /opt/pycharm-2024.1/plugins/python/helpers/pydev/pydev_ipython/static/custom
• Flatpak安装版：路径会是 ~/.var/app/com.jetbrains.PyCharm-Community/data/JetBrains/PyCharm<版本号>/plugins/python/helpers/pydev/pydev_ipython/static/custom

你可以先打开终端，用find命令快速定位：

find /opt -name "pydev_ipython" | grep static/custom

步骤2：修改自定义CSS文件 #

进入上面找到的custom目录，你会看到一个custom.css文件（如果没有就新建一个）。打开它，添加针对Markdown单元格的样式规则：

/* 修改Markdown单元格的字体族和字号 */
.jp-MarkdownCell .jp-RenderedMarkdown {
    font-family: "Ubuntu", "Noto Sans", sans-serif; /* 替换成你喜欢的字体 */
    font-size: 16px; /* 调整到合适的字号 */
}

/* 兼容旧版本PyCharm的选择器（如果上面的不生效） */
.text_cell_render {
    font-family: "Ubuntu", "Noto Sans", sans-serif;
    font-size: 16px;
}

根据你的PyCharm版本，可能需要用其中一个选择器——新版本的PyCharm用的是JupyterLab风格的类名（jp-*），旧版本还是沿用老的IPython Notebook类名。

步骤3：重启PyCharm生效 #

保存修改后，完全关闭PyCharm再重新打开，打开你的Notebook文件，就能看到Markdown单元格的字体已经变化了。

注意事项 #

• PyCharm升级的时候，这个插件目录下的文件可能会被覆盖，所以建议你备份修改后的custom.css，升级后再重新替换回去。
• 如果不想每次升级都折腾，也可以试试PyCharm的外观自定义插件，但针对Notebook单元格的样式，直接修改内置CSS是最直接的方案。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Madhuranga