我之前也碰到过一模一样的问题，结合你给出的代码片段，咱们一步步拆解可能的原因和对应的解决办法：

1. 核心问题：没正确读取本地上传的文件内容 #

你的代码里只拿到了上传文件的原始文件名$filename，但完全没处理PHP上传文件的临时存储路径。PHP会把上传的文件先存在服务器临时目录，路径存在$_FILES["fileToUpload"]["tmp_name"]里——如果直接创建远程文件但不把临时文件的内容写进去，远程文件自然就是0字节。

解决代码示例：

<?php 
if(isset($_POST["submit"])) { 
    $filename = $_FILES["fileToUpload"]["name"];
    $localTmpFile = $_FILES["fileToUpload"]["tmp_name"]; // 关键：获取本地临时文件路径
    
    require_once('/home/Script_Server/login_server_ftp.php'); 
    $resConnection = ssh2_connect($strServer, $strServerPort); 

    if(ssh2_auth_password($resConnection, $strServerUsername, $strServerPassword)){ 
        echo "connected"; 
        $resSFTP = ssh2_sftp($resConnection); 

        // 拼接远程文件完整路径
        $remoteFilePath = "ssh2.sftp://{$resSFTP}/var/www/html/mysite.com/folder/" . $filename;
        $remoteFileHandle = fopen($remoteFilePath, 'w');
        
        // 读取本地临时文件内容并写入远程
        if ($remoteFileHandle) {
            fwrite($remoteFileHandle, file_get_contents($localTmpFile));
            fflush($remoteFileHandle); // 强制刷新缓冲区
            fclose($remoteFileHandle);
            echo "文件上传成功";
        } else {
            echo "无法打开远程文件";
        }
        
        ssh2_disconnect($resConnection);
    } else {
        echo "SFTP认证失败";
    }
}

2. 远程目录权限不足 #

如果远程目录/var/www/html/mysite.com/folder/没有给SFTP用户写入权限，系统可能允许你创建空文件，但无法写入内容，最终就是0字节。

排查与解决：

• 登录目标服务器，用ls -l /var/www/html/mysite.com/查看目录权限，确保SFTP所属的用户/用户组有w（写入）权限。
• 可以先在代码里加个权限测试：

$testFile = "ssh2.sftp://{$resSFTP}/var/www/html/mysite.com/folder/test_perm.txt";
$testHandle = fopen($testFile, 'w');
if ($testHandle) {
    fwrite($testHandle, "权限测试内容");
    fclose($testHandle);
    echo "目录权限正常";
    unlink($testFile); // 测试完删除文件
} else {
    echo "远程目录无写入权限，请调整权限";
}

3. SSH2扩展缓冲区未刷新 #

有时候ssh2的fwrite不会立即把内容写入远程服务器，程序提前断开连接后，缓冲区的内容丢失，导致文件为空。

解决办法：
在fwrite之后调用fflush($remoteFileHandle)强制刷新缓冲区，再关闭文件句柄，最后断开SFTP连接（就像上面代码示例里那样）。

4. 大文件导致内存不足或超时 #

如果上传的文件很大，用file_get_contents一次性读取整个文件会占用大量内存，可能导致读取失败，进而写入空内容。

解决办法：分块读写
用循环分块读取本地文件，再写入远程，避免内存溢出：

$localHandle = fopen($localTmpFile, 'rb');
$remoteHandle = fopen($remoteFilePath, 'wb');

// 每次读取8KB分块写入
while (!feof($localHandle)) {
    fwrite($remoteHandle, fread($localHandle, 8192));
}

fclose($localHandle);
fclose($remoteHandle);

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Th3Gh0st