为何NetworkX生成的最大/最小生成树完全相同?
解决NetworkX中最大/最小生成树完全一致的问题
嘿,我之前也碰到过类似的情况,咱们一步步来排查问题:
所有边的权重完全相同
这是最常见的原因。如果你的pearson_net里每条边的权重数值都一样,那不管是找最大还是最小生成树,算法随便挑一棵生成树就行,结果自然完全重合。
你可以跑这段代码验证一下:# 提取所有边的权重值 weights = [d['weight'] for u, v, d in pearson_net.edges(data=True)] # 检查是否所有权重都相同 print(all(w == weights[0] for w in weights))原始图本身就是一棵生成树
如果你的pearson_net本身已经是没有环的树结构,那它的生成树只能是自己,不管最大还是最小生成树,结果肯定一模一样。你可以用nx.is_tree(pearson_net)来验证这个猜想。权重的键名不匹配
NetworkX的maximum_spanning_tree和minimum_spanning_tree默认会读取边属性里的'weight'键。如果你的皮尔逊相关系数存在其他键(比如'pearson'),那函数会默认把所有边的权重当成1,相当于所有边权重相同,最终生成树自然一致。
解决办法是调用函数时指定正确的权重键,比如:a = nx.maximum_spanning_tree(pearson_net, weight='pearson') b = nx.minimum_spanning_tree(pearson_net, weight='pearson')权重是无差异的单一变换值
比如所有权重都是同一个数的等比例倍数,或者全是正数但没有大小差异,也会导致生成树一致。这种情况还是回到第一个原因的排查方法就行。
你可以先从这几个方向排查,应该能找到问题所在~
内容的提问来源于stack exchange,提问作者taylor
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