如何在knitr中使用需交互输入的rebus.pls函数生成静态报告？

我太懂你这个困扰了——rebus.pls这函数默认会先弹出树状图，然后等着你手动输入类别数量才能继续，这在想用knitr生成静态报告的时候确实有点卡手。下面给你两种实用的解决方案，按需选就行：

方案一：编织时手动输入（繁琐但直接贴合原生逻辑） #

如果你能接受编织过程中手动干预一下，那最简单的方式就是在Rmd里正常调用函数，但一定要在交互式环境里编织（比如用RStudio的「Knit」按钮，别用命令行非交互式编织）。

具体操作步骤：

• 在Rmd的代码块里直接写调用代码：

  library(plspm)
  # 假设你已经准备好对应的plspm对象和数据
  rebus.pls(your_plspm_object)
  

• 点击Knit按钮开始编织，当函数运行到需要输入类别数的环节时，RStudio会在控制台弹出输入提示（或者直接出输入框），你手动敲入数字回车，编织流程就会继续走下去，最终生成包含树状图和后续分析结果的静态报告。

这个方法的缺点是每次编织都得手动操作，但好处是完全不用改函数逻辑，能保留rebus.pls的所有原生行为。

方案二：预先指定类别数量，彻底跳过交互 #

要是想实现全自动化编织，不用手动输入，我们可以绕开函数的交互逻辑，直接把类别数预先传进去。因为rebus.pls本身没提供直接指定类别数的参数，这里给你两种靠谱的实现方式：

方法A：用模拟输入自动传递参数（Windows环境适用） #

如果你用的是Windows系统，可以借助sendkeys包模拟键盘输入，提前把预设的类别数传给函数：

library(plspm)
library(sendkeys)

# 先发送预设的类别数（比如这里指定3），再调用函数
sendkeys::sendkeys("3{ENTER}")
# 加个短暂延迟确保输入被捕获，可选
Sys.sleep(0.5)
rebus.pls(your_plspm_object)

注意：这个方法要确保函数弹出输入提示时，模拟的按键能被及时捕获，偶尔可能需要调整延迟时间。

方法B：直接调用函数内部逻辑，完全自定义 #

更稳定的方式是扒一下rebus.pls的源代码，跳过它的交互步骤，直接传入你预设的类别数。其实rebus.pls核心是先调用rebus()生成前置结果，再基于类别数做聚类和绘图，我们可以把这个流程拆出来手动实现：

library(plspm)

# 先获取rebus.pls的前置计算结果
rebus_core_res <- rebus(your_plspm_object)
# 预先指定你想要的类别数量
target_k <- 3

# 执行聚类并绘制树状图，和rebus.pls的逻辑一致
hc_model <- hclust(as.dist(1 - rebus_core_res$tau), method = "ward.D2")
cluster_result <- cutree(hc_model, k = target_k)
plot(hc_model, labels = rownames(your_plspm_object$scores), main = "Hierarchical Clustering")
rect.hclust(hc_model, k = target_k, border = 2:6)

# 后续的分析步骤可以参考rebus.pls的源代码继续补充

这个方法完全摆脱了交互，适合批量生成报告或者自动化流程，唯一需要注意的是要对照rebus.pls的源代码，确保后续分析逻辑和原生函数一致。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ann