寻求Julia中具备磁盘存储及特定数组操作特性的Array-like类型
嘿,我整理了几个完全符合你需求的Julia工具,刚好匹配你要的磁盘驻留类数组、按需读写、支持常用操作这些特性:
推荐满足需求的Julia磁盘驻留类数组类型
1. DiskArrays.jl
这货就是专门为磁盘上的类数组场景设计的,完美踩中你的核心需求:
- 按需加载:只会把你实际访问的元素读进内存,不用整个数组都占着内存
- 基础操作:完全支持
getindex、setindex!,改单个元素直接写磁盘,不用动整个数组 - 复合类型:随便存你自定义的复合类型,只要配合JLD2或者Zarr这种序列化格式就行
- 动态操作:原生虽然没直接支持
push!/pop!,但结合Zarr的可变维度功能就能实现;vcat也能通过拼接磁盘分块搞定,效率还不错
2. JuliaDB
你提到的JuliaDB其实完全能打,它的IndexedTable或者NDSparse结构可以直接把数据持久化到磁盘:
- 按需读写:只加载你需要的元素,单元素修改、读取都没问题
- 动态操作:原生就支持
push!、pop!、shift!、unshift!这些动态数组操作,vcat合并数据集更是小菜一碟 - 复合类型:完全支持存储复合类型,还能给复合类型的字段建索引,查起来更快
- 小提醒:它的API和原生数组有点不一样,但适配起来很简单,学习成本很低
3. Zarr.jl
基于Zarr格式的磁盘数组实现,分块存储的设计天生适合你的需求:
- 单元素操作:支持直接读写单个元素,不用动整个数组,按需加载也做得很好
- 动态功能:可以建可变维度的数组,轻松实现
push!/pop!这类操作;vcat通过合并分块就能完成 - 复合类型:只要是Julia能序列化的类型(包括你自定义的复合类型)都能存
- 额外buff:还能和其他语言的Zarr工具交互,跨语言协作很方便
对了,你提到的SharedArrays是给多进程共享内存用的,数据还是在内存里,不满足磁盘存储的需求,所以可以pass掉
场景选型建议
- 想要最贴近原生数组的体验:选DiskArrays.jl准没错
- 既要数组操作又要数据索引功能:JuliaDB更合适
- 需要跨语言兼容或者分块存储优化:Zarr.jl是最佳选择
内容的提问来源于stack exchange,提问作者plan
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