IPython控制台调用matplotlib.pyplot出现Bus error (core dumped)求助

嘿，针对你在Ubuntu 16.04的Anaconda环境下，IPython控制台用matplotlib绘图频繁出现Bus error (core dumped)的问题——毕竟Jupyter里用%matplotlib inline完全正常，你怀疑Qt5的问题确实很有道理。结合你的情况，我整理了几个针对性的排查和解决方法，你可以一步步试试：

1. 临时切换matplotlib后端测试 #

既然Jupyter的inline后端没问题，你可以在IPython控制台里手动指定非Qt的后端快速验证：

• 启动IPython后，依次输入：

  import matplotlib
  matplotlib.use('Agg')  # 也可以试试'TkAgg'，取决于你系统的支持情况
  import matplotlib.pyplot as plt
  

  然后尝试绘制简单图表（比如plt.plot([1,2,3])），如果不再报错，那基本可以确认是Qt后端的兼容性问题。

  要是临时切换有效，还能把这个配置永久生效：

  • 先找到matplotlib的配置文件路径：

    import matplotlib
    print(matplotlib.matplotlib_fname())
    

  • 打开这个文件，找到backend一行，修改为backend: Agg或者backend: TkAgg，保存后重启IPython即可。

2. 重装Anaconda的Qt相关依赖包 #

大概率是Qt5或PyQt的包损坏、版本不兼容导致的，试试重装相关组件：

• 打开终端，先激活你的Anaconda环境（如果用了虚拟环境），然后执行：

  conda remove qt pyqt
  conda install qt pyqt
  

  要是重装最新版还是有问题，可以指定适配Ubuntu 16.04的稳定版本：

  conda install qt=5.9 pyqt=5.9
  

  重装完成后重启IPython再测试绘图。

3. 补充系统级Qt依赖 #

Anaconda的Qt可能和Ubuntu 16.04系统自带的Qt组件有冲突，试试安装系统级的Qt5依赖：

• 在终端执行：

  sudo apt-get install qt5-default libqt5gui5 libqt5core5a libqt5widgets5
  

  安装完成后再启动IPython测试。

4. 用IPython魔法命令默认切换后端 #

你也可以直接用IPython的魔法命令设置默认后端，避免每次手动切换：

• 在IPython里输入：

  %matplotlib agg  # 或者%matplotlib tk
  

  测试绘图正常后，还能把这个配置加到IPython的默认启动项里：
  • 先生成IPython配置文件（如果还没有）：

    ipython profile create
    

  • 打开~/.ipython/profile_default/ipython_config.py，添加一行：

    c.InteractiveShellApp.matplotlib = 'agg'
    

  保存后重启IPython，每次启动就会自动加载这个后端。

5. 对比两台笔记本的环境细节 #

既然另一台配置相同的电脑能正常运行，你可以对比两者的环境差异定位问题：

• 分别在两台电脑执行conda list，导出环境列表，对比Qt、PyQt、matplotlib的版本是否完全一致；
• 检查IPython的配置文件内容是否相同；
• 执行dpkg -l | grep qt5，对比两台电脑的系统级Qt包版本。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Justin Solms