Ubuntu 16.04下RStudio 1.1安装rgdal包报错求助

你遇到的是Anaconda自带编译器和系统GDAL依赖库不兼容导致的configure阶段失败问题，我给你几个实用的解决思路：

方法一：临时切换到系统编译器 #

在RStudio控制台里先执行以下命令，让R优先调用Ubuntu系统自带的gcc/g++编译器：

Sys.setenv(CC = "/usr/bin/gcc")
Sys.setenv(CXX = "/usr/bin/g++")

之后重新执行安装命令：

install.packages('rgdal', type = "source")

方法二：先安装系统层面的依赖库 #

rgdal依赖GDAL、PROJ.4等底层库，先在Ubuntu终端里安装这些必备依赖：

sudo apt-get update
sudo apt-get install libgdal-dev libproj-dev libgeos-dev

安装完成后回到RStudio，若仍有问题，可手动指定系统库路径安装：

install.packages('rgdal', configure.args = c("--with-gdal-config=/usr/bin/gdal-config", "--with-proj-include=/usr/include/proj", "--with-proj-lib=/usr/lib/x86_64-linux-gnu"))

方法三：通过Anaconda直接安装 #

既然你在用Anaconda，也可以尝试从conda-forge通道统一安装，在Ubuntu终端执行：

conda install -c conda-forge r-rgdal

安装完成后打开RStudio，就能直接加载rgdal库使用了。

这几个方法里，前两个是源码安装的常规解决方案，第三个更适配Anaconda的环境管理逻辑，你可以根据自己的需求尝试。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者D. Ror.