如何在MacOS X Automator中从.Rmd文件生成PDF文档？

我太懂这种在终端里跑命令好好的，放到Automator就各种工具找不到的憋屈了！本质原因是Automator运行shell脚本时用的是系统默认的受限PATH环境变量，和你平时终端里的PATH完全不一样——哪怕你装了xelatex，它也搜不到对应的路径。

下面给你几个靠谱的解决办法，按从简单到通用的顺序来：

方法1：直接给PATH添加xelatex的路径 #

首先先在终端里找到xelatex的绝对路径，运行：

which xelatex

你大概率会得到类似 /Library/TeX/texbin/xelatex 的结果（不同TeX发行版可能路径略有差异，比如MacTeX就是这个路径）。

然后在你的Automator shell脚本最开头加上这一行，把xelatex的路径加到PATH里：

export PATH="/Library/TeX/texbin:$PATH"

如果之前你还指定了Rscript和pandoc的路径，也可以一起合并到这行里，比如：

export PATH="/usr/local/bin:/Library/TeX/texbin:$PATH"

（把你找到的Rscript、pandoc的路径也放进去）

这样脚本后续执行时，就能找到所有需要的工具了。

方法2：导入终端的完整PATH环境变量 #

如果你不想一个个找路径，可以直接把终端里的完整PATH导入到Automator脚本里：

1. 打开终端，运行 echo $PATH，复制输出的一长串路径内容
2. 在Automator脚本的最开头添加：

export PATH="你复制的完整PATH内容:$PATH"

这样Automator的环境就和你平时用的终端完全一致，所有工具都能正常找到。

方法3：加载你的shell配置文件 #

如果你平时在终端里靠.zshrc或者.bash_profile配置PATH，那直接在脚本开头加载这个配置文件就行：

• 如果你用zsh（现在Mac默认是zsh）：

source ~/.zshrc

• 如果你用bash：

source ~/.bash_profile

这样就能继承所有你在终端里的环境变量设置，一劳永逸解决工具找不到的问题。

额外注意点 #

• 确保Automator的「运行Shell脚本」动作里，选择的shell和你平时终端用的一致（比如/bin/zsh或者/bin/bash），在动作的下拉菜单里可以选。
• 测试前可以先在脚本里加一行 echo $PATH，运行Automator后看输出的PATH是否包含了xelatex的路径，方便排查问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Connor Cotton