在Amazon Linux 2017.09.1安装rJava时gcc找不到libgomp.spec的问题求助
解决Amazon Linux 2017.09.1上安装rJava时gcc找不到libgomp.spec的问题
我之前在Amazon Linux 2017.09.1的Lightsail实例上折腾rJava安装时,碰到过几乎一模一样的gcc找不到libgomp.spec的问题,给你几个亲测有效的解决方向:
方法1:将符号链接创建到gcc的默认搜索路径
gcc会在其libgcc所在的目录优先查找相关spec文件,你可以通过以下命令获取这个路径:
dirname $(gcc -print-libgcc-file-name)
执行后会得到类似/usr/lib/gcc/x86_64-amazon-linux/6的路径,接下来直接把已找到的libgomp.spec链接到这个目录:
sudo ln -s /usr/lib/gcc/x86_64-amazon-linux/6.4.1/libgomp.spec $(dirname $(gcc -print-libgcc-file-name))/libgomp.spec
这个方法的优势是不需要额外设置环境变量,让gcc自动找到文件,我当时就是用这个方法解决的问题。
方法2:直接指定gcc的spec文件路径
如果方法1无效,你可以在安装rJava前,通过环境变量告诉gcclibgomp.spec的具体位置:
export GCC_SPECS=/usr/lib/gcc/x86_64-amazon-linux/6.4.1/libgomp.spec
然后再在R环境中执行:
install.packages("rJava")
这种方式强制gcc使用你指定的spec文件,跳过默认路径查找。
方法3:补全gcc相关开发包
有时候缺失完整的gcc开发套件也会导致这类路径问题,你可以先尝试安装相关依赖:
sudo yum install gcc-gfortran gcc-c++ libgomp-devel -y
安装完成后再重新尝试安装rJava,这套包可能会自动修复spec文件的路径关联。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者3D0G
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