听起来你遇到了克隆conda环境后双重糟心的问题：权限访问报错，连python命令都跑不起来了。别慌，我们一步步来解决，全程不需要root权限：

第一步：先恢复python命令的可执行性 #

这是最优先的，命令都用不了的话后续操作没法进行：

• 检查并重新激活环境
  先确认你当前是否在目标环境里，执行：

  conda info --envs
  

  看输出里带*的是不是你克隆的那个环境。如果不是，用conda activate <你的环境名>重新激活；如果激活报错，试试用完整路径激活：

  source ~/miniconda3/envs/<你的环境名>/bin/activate
  

• 检查环境内Python文件的权限
  进入你的环境bin目录（比如~/miniconda3/envs/<环境名>/bin），查看python文件的权限：

  cd ~/miniconda3/envs/<你的环境名>/bin
  ls -l python
  

  如果输出里没有x（可执行权限），给自己加上：

  chmod +x python python3.6
  

  这个操作完全不需要root，因为是你自己的环境目录。
• 修正PATH环境变量
  有时候环境切换异常会导致系统找不到conda环境里的Python，执行echo $PATH看看你的环境bin目录是不是在最前面。如果不是，临时添加：

  export PATH=~/miniconda3/envs/<你的环境名>/bin:$PATH
  

  要是想永久生效，就把上面这行加到~/.bashrc（bash用户）或~/.zshrc（zsh用户）里，然后执行source ~/.bashrc生效。

第二步：解决克隆环境的权限访问问题 #

搞定Python命令后，我们来处理权限报错：

• 重新克隆到个人目录（推荐）
  如果你之前克隆时没指定安装位置，可能默认装到了系统级conda目录（导致权限不足）。重新克隆时明确指定安装在你的home目录下：

  conda create --name <新环境名> --file spec-file.txt --prefix ~/my_custom_envs/<新环境名>
  

  这样所有文件的所有者都是你，绝对不会有权限问题。
• 修复现有环境的权限
  要是不想重新克隆，直接给现有环境目录递归加权限：

  chmod -R u+rwX ~/miniconda3/envs/<你的环境名>
  

  这里u+rwX是给你自己加读、写、执行权限（X只会给目录和本来就有执行权的文件加，不会乱加权限），完全安全且不需要root。
• 强制重装异常依赖包
  有些时候克隆的依赖包会指向原机器的路径，导致访问失败。执行conda list查看每个包的prefix列，要是发现有指向原机器的路径，就强制重装该包：

  conda install --force-reinstall <有问题的包名>
  

  这会把包重新安装到你的当前环境里。

避坑提醒 #

• 绝对不要用sudo conda执行任何命令！这会把环境文件的所有者改成root，导致你自己的用户完全访问不了。要是之前不小心用了，执行下面的命令把权限改回自己：

  chown -R $USER:$USER ~/miniconda3
  

  （这个命令在你的home目录下执行不需要root，因为你是home的所有者）
• 确认你的conda是个人安装的，不是系统级的。如果是系统级conda，那确实可能有很多权限问题，最好自己重新装一个个人版conda到~/miniconda3目录，全程不需要root。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user1315621