如何通过sourceCpp修改Rcpp编译的-O2与-mtune参数？

当然可以调整这些编译参数！在Rcpp里有两种简单直接的方式实现你的需求，完全适配你当前的环境：

方法1：直接在sourceCpp调用中指定参数 #

你可以通过cpp.args参数直接传递自定义编译选项给g++，覆盖默认的设置。只需要把调用改成这样：

sourceCpp("scoreseq1.1.cc", verbose=TRUE, cpp.args = c("-O3", "-mtune=haswell"))

执行时，g++会优先使用你指定的-O3优化级别和-mtune=haswell架构调优，而不是默认的-O2和-mtune=core2。GCC会自动以最后指定的优化/调优参数为准，不用担心参数冲突的问题。

方法2：设置全局编译选项（一劳永逸） #

如果希望每次调用sourceCpp都自动应用这些参数，可以修改R的编译配置文件：

1. 打开Windows文件资源管理器，导航到你的用户目录（比如C:\Users\你的用户名），如果没有.R文件夹就手动创建一个。
2. 在.R文件夹里创建或编辑Makevars.win文件，添加以下内容：

CXXFLAGS += -O3 -mtune=haswell

3. 保存文件后重启R，之后所有通过Rcpp编译的C++代码都会自动套用这些编译选项。

小提示 #

• -O3会比-O2开启更多深度优化选项，可能会稍微延长编译时间，但对需要重复调用的计算密集型函数，性能提升会很明显。
• -mtune=haswell是针对Haswell架构CPU做的指令集优化，如果你使用的是2013年后的Intel CPU（或兼容架构的AMD CPU），这个设置能充分发挥硬件性能。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Bobert