事后分析中先去除无意义配对比较再行多重比较校正是否恰当？

核心结论：预先排除无意义的配对比较后再做校正完全合适，且更贴合研究逻辑，但要注意正确指定对比组合，避免过度校正。 #

下面展开说几个关键细节：

1. 预先设定对比是严谨的做法
   你已经有明确的研究依据（第2对照组和第1干预组密切相关，与第2干预组的配对无实际研究意义），这种预先指定要开展的对比是统计分析中非常规范的操作——既避免了“探索性分析后选择性报告结果”的偏倚，也让你的分析逻辑完全服务于研究目的，完全站得住脚。

2. 不要事后删结果，要在多重比较时直接指定对比
   如果你直接用Stata默认的dunntest outcome, by(group)命令，它会自动执行所有6组两两比较，此时校正是基于6次检验的。如果事后手动忽略第2对照组和第2干预组的对比，相当于你还是用了6次检验的校正标准，会让其他有意义的对比的p值被过度校正（更难得到显著结果），浪费统计效力。

   正确的做法是在dunntest里直接指定你需要的对比组合。假设你的分组变量group的取值为1（对照1）、2（对照2）、3（干预1）、4（干预2），命令应该写成：

   dunntest outcome, by(group) compare(1-2 1-3 1-4 2-3)
   

   这样命令只会执行你指定的4组对比，校正也是基于4次检验的，结果更准确合理。

3. 报告时要明确说明分析逻辑
   在你的研究报告或论文中，一定要清晰说明：

   • 你预先设定了哪些组间对比
   • 为什么排除第2对照组和第2干预组的比较（基于你的研究设计逻辑）
     这能让审稿人或读者完全理解你的分析思路，不会质疑你是为了得到阳性结果而调整对比。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user195769