刚好做过不少CCA的分析解读，来帮你理清楚这两个图的含义，先从最基础的解读逻辑说起，再对应你的案例拆解：

一、CCA图中环境因子向量的核心解读规则 #

先把最关键的几个规则拎出来，这是解读所有CCA图的基础：

• 向量长度：代表该环境因子对目标类群（比如你的变形菌门）分布的解释力强弱——向量越长，说明这个因子对群落分布的影响越大；越短则影响可以忽略。
• 向量夹角：
  • 夹角小于90°：两个因子呈正相关，夹角越小，相关性越强（比如深度越深，盐度越高）；
  • 夹角等于90°（正交）：两个因子几乎没有线性关联，彼此独立；
  • 夹角大于90°：两个因子呈负相关，夹角越接近180°，负相关性越强（比如深度越深，盐度越低）。
• 向量象限位置：代表因子的梯度方向，比如某个因子落在第一象限，说明该因子的高值样本主要聚集在图的第一象限区域；反之则是低值样本聚集区。

二、针对你的两个CCA图案例分析 #

案例1：变形菌门CCA图——salinity（盐度）在第二象限、depth（深度）在第三象限且近乎正交 #

• 首先，两个向量近乎正交，这是最核心的信号：盐度和深度这两个因子之间几乎没有线性关联——简单说就是你的样本里，深度的深浅和盐度的高低没有明显的对应规律，不会出现“越深的地方盐度越高/越低”的情况。
• 象限分布的意义：盐度的高值样本集中在第二象限，深度的高值样本集中在第三象限，说明这两个因子的影响区域是分开的。对应变形菌门的话，就是变形菌门的群落分布可能分别受盐度和深度的独立影响，不存在“高盐+深水区”这种两个因子共同作用的典型生境。

案例2：另一张CCA图——depth在第一象限、salinity在第二象限 #

• 重点看两个向量的夹角：如果夹角小于90°，说明盐度和深度呈正相关——你的样本里大概率是深度越深的区域，盐度也越高；如果夹角接近90°，那还是弱关联，但象限都在右侧，说明它们的高值样本区域有重叠。
• 象限分布的意义：两个因子都落在右侧象限，说明高盐度和高深度的样本主要集中在图的右侧区域，这意味着这两个因子可能共同影响对应类群的群落分布——比如某些物种会更偏好“高盐+深水区”这种生境，而另一些物种则偏好相反的区域。

三、解读CCA图的完整步骤总结 #

给你梳理一套通用的解读流程，以后遇到类似图都可以这么来：

1. 先看环境因子的向量长度，优先关注最长的几个因子——这些是影响群落分布的核心变量；
2. 分析因子之间的夹角，判断因子间的相关性，搞清楚哪些因子是协同作用，哪些是独立作用；
3. 结合样本点的分布（如果图里有的话），看哪些样本聚集在某个因子的高值/低值区，对应到实际生境；
4. 如果有物种/类群的点，看物种点和环境因子向量的夹角——夹角越小，说明该物种越偏好这个因子的高值环境；夹角越大（接近180°），则越偏好低值环境。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Plumeria