我之前也踩过这个坑——.mlapp本质是打包了布局XML和代码的压缩包，Git默认把它当二进制文件，根本没法做正常的diff和merge。结合MATLAB官方文档和Mac下的Git配置逻辑，给你整理了一套能直接用的步骤：

1. 创建MATLAB diff/merge的Shell脚本 #

首先我们需要两个脚本，让Git调用MATLAB自带的差异对比和合并工具。

1.1 编写diff脚本 #

在~/bin目录下创建mlapp-diff.sh（如果~/bin不存在，先执行mkdir ~/bin），内容如下：

#!/bin/bash
# 调用MATLAB的mlDiff工具对比两个.mlapp文件
matlab -batch "mlDiff('$1', '$2')"

1.2 编写merge脚本 #

同样在~/bin下创建mlapp-merge.sh，内容：

#!/bin/bash
# 调用MATLAB的mlMerge工具处理合并，参数对应Git传入的版本文件
# %O=基础版本, %A=本地版本, %B=远程版本, %P=输出路径
matlab -batch "mlMerge('$1', '$2', '$3', '$4')"

1.3 给脚本加执行权限 #

打开终端执行：

chmod +x ~/bin/mlapp-diff.sh ~/bin/mlapp-merge.sh

1.4 确保脚本路径在系统PATH中 #

如果~/bin还没加入PATH，编辑你的shell配置文件（比如~/.zshrc或~/.bash_profile），添加一行：

export PATH="$HOME/bin:$PATH"

然后执行source ~/.zshrc（或对应的配置文件）让改动生效。

另外要确保matlab命令能在终端直接调用——如果不行，把MATLAB的bin目录也加到PATH里，比如：

export PATH="/Applications/MATLAB_R2023a.app/bin:$PATH"

（路径根据你安装的MATLAB版本调整）

2. 配置Git识别.mlapp文件 #

2.1 配置.gitattributes #

在你的Git仓库根目录创建.gitattributes文件，添加：

*.mlapp diff=mlapp merge=mlapp

这行告诉Git，所有.mlapp文件用我们自定义的mlapp规则来处理diff和merge。

2.2 配置Git的diff和merge驱动 #

执行下面的命令（如果只想给当前仓库配置，去掉--global参数）：

# 配置diff工具
git config --global diff.mlapp.command mlapp-diff.sh
# 配置merge驱动
git config --global merge.mlapp.driver "mlapp-merge.sh %O %A %B %P"

3. 测试配置 #

现在修改一个.mlapp文件，执行git diff someApp.mlapp，应该会自动启动MATLAB的差异对比工具，展示可视化的diff结果；如果遇到合并冲突，Git也会调用MATLAB的merge工具来帮你处理。

注意：mlDiff和mlMerge是MATLAB R2020b及以后版本才有的功能，如果你的版本更老，可能需要先解压.mlapp文件（用unzip命令），手动对比里面的appdesigner.json和代码文件，但官方工具显然更省心。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者pscl