Ubuntu 17.10下已用apt-get安装libhdf5-dev但gcc无法找到的问题

Hey，我之前也碰到过类似的情况——明明用apt-get装了libhdf5-dev，编译时却死活找不到库，大概率是编译参数没配对或者库路径的小细节没注意到，试试下面这些方法：

1. 先确认库文件是否真的安装到位 #

首先用这条命令查看libhdf5-dev安装的所有文件，确保头文件和库文件确实存在：

dpkg -L libhdf5-dev

正常情况下你应该能看到类似这些路径：

• 头文件：/usr/include/hdf5/serial/hdf5.h
• 库文件：/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial/libhdf5.so
  如果这些路径不存在，说明安装可能出了问题，执行sudo apt-get install --reinstall libhdf5-dev重新安装修复即可。

2. 用pkg-config自动获取编译参数 #

HDF5的库链接需要特定的参数，手动加-lhdf5经常不够用，最好用pkg-config来自动生成正确的编译和链接选项。把你的编译命令改成这样：

gcc your_source_code.c -o your_program $(pkg-config --cflags --libs hdf5)

如果执行时提示Package hdf5 was not found in the pkg-config search path，先手动添加pkg-config的搜索路径：

export PKG_CONFIG_PATH=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/pkgconfig:$PKG_CONFIG_PATH

然后执行pkg-config --list-all | grep hdf5，如果能看到hdf5的条目，说明路径配置成功了。

3. 手动指定头文件和库路径（如果pkg-config不管用） #

Ubuntu 17.10里的libhdf5-dev可能把文件放在serial子目录下，手动指定路径的编译命令如下：

gcc your_source_code.c -o your_program -I/usr/include/hdf5/serial -L/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial -lhdf5

• -I用来指定头文件搜索路径，解决找不到hdf5.h的问题
• -L用来指定库文件搜索路径，解决链接时找不到libhdf5的问题
• -lhdf5告诉链接器要链接HDF5库

4. 检查具体的错误信息 #

如果还是不行，把编译时的错误信息贴出来会更有助于精准排查：

• 如果是fatal error: hdf5.h: No such file or directory：说明头文件路径没加对
• 如果是undefined reference to H5Fcreate'`这类链接错误：说明库没正确链接

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Victor Poughon