使用Knitr在R Markdown中编译多行LaTeX公式PDF报错求助

看起来你遇到的问题根源有两个：一是在LaTeX的align环境里错误使用了HTML转义字符&（应该用原生的&），二是需要确保你的LaTeX文档加载了amsmath包（align环境属于这个包）。

问题分析 #

• 转义字符错误：你在align里写的&是HTML中表示&的转义字符，但输出PDF时，pandoc会把这个直接传给LaTeX——而LaTeX的align环境需要用&来对齐公式，&会被判定为无效语法，直接触发编译报错。
• 缺少依赖包：align是amsmath宏包提供的环境，默认的pandoc模板可能没有自动加载这个包，导致LaTeX无法识别该环境。

解决方案 #

修改你的R Markdown代码如下：

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title: "Test"
date: "1/16/2018"
output: 
  pdf_document:
    extra_dependencies: amsmath
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## R Markdown
Testing to see if a multi-line latex equation works.
#### Test 1:
$$ f(x) = x^5 + x^3 + x $$
$$ g(x) = y^{x+1} $$
#### Test 2:
\begin{align}
f(x) &= x^5 + x^3 + x \\
g(x) &= y^{x+1}
\end{align}

关键修改点 #

1. 替换&为&：LaTeX的对齐符号就是原生的&，不需要转义——这是HTML输出和PDF输出的核心差异之一。
2. 在YAML中添加amsmath依赖：通过extra_dependencies: amsmath告诉pandoc在生成LaTeX文档时自动加载amsmath包，让align环境能被正常识别。

如果你更习惯用LaTeX原生命令，也可以在文档开头手动引入包（不过YAML配置的方式更符合R Markdown的最佳实践）：

\usepackage{amsmath}

验证效果 #

修改后重新编译PDF，Test 2的align公式应该能正常渲染，效果和HTML输出保持一致。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Guy Dotan