如何在R Markdown中同时设置浮动目录与开头目录？

当然可以同时拥有文档开头的静态目录和右侧的浮动目录啦！你之前报错，应该是不小心重复定义了toc参数（比如错误地在toc_float的子设置里又加了一遍toc: true）——其实在R Markdown的YAML配置里，toc和toc_float是html_document下两个独立的参数，合理设置根本不会冲突。

下面给你两种实用的实现方法，按需选就行：

方法一：自动生成双目录（推荐，适合长文档） #

这个方法能让系统自动生成两个目录，只需要两步：

1. 正确配置YAML元数据
   保留toc: true（负责生成开头的静态目录）和toc_float（负责右侧浮动目录），注意不要重复写toc参数：

   ---
   title: "TEST"
   author: brettljausn
   date: January 15, 2018
   output:
     html_document:
       toc: true  # 开启静态开头目录
       toc_float: # 开启右侧浮动目录
         toc_collapsed: true
         toc_depth: 3
       number_sections: true
       theme: lumen
   ---
   

2. 添加自定义CSS让静态目录显示
   默认情况下，开启toc_float后，开头的静态目录会被主题CSS隐藏。我们只要加一小段CSS就能让它显示出来，还能顺便美化一下：

   .toc {
     display: block !important;
     margin: 2em 0;
     padding: 1em;
     border: 1px solid #eee;
     border-radius: 4px;
   }
   

   把这段代码块放在文档任意位置（建议末尾）就行，点击Knit后，你就能看到开头的静态目录和右侧的浮动目录同时存在啦！

方法二：手动编写静态目录（适合短文档） #

如果你的文档内容不多，也可以手动写开头的目录：

• 先把YAML里的toc: true删掉，保留toc_float的设置
• 在文档最开头手动用Markdown列表写目录，比如：

  # 目录
  - [R Markdown](#r-markdown)
    - [Including Plots](#including-plots)
  

  这里的#r-markdown是标题的锚点，和你的章节标题对应（注意小写，空格换成短横线）。这种方式完全可控，但文档标题多了的话维护起来会有点麻烦。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者f.lechleitner