R ggplot2 log10转换scale_y_continuous设置ylim后柱形缺失

ggplot2中两类纵轴范围设置的逻辑存在本质差异，是触发柱形缺失的根本原因：

• scale_y_continuous(limits = c(下限, 上限)) 执行数据级过滤：几何对象完成渲染前，系统会直接剔除所有关联坐标点不在limits区间内的数据；只要某几何对象的任意坐标点落在区间外，整个对象会被完全删除，而非裁切显示。
• geom_bar(stat = "identity") 默认将柱形底部锚定在y=0，柱形完整绘制范围是从y=0（底）到映射的y值（顶）。结合log10转换规则，y=0对应的转换后数值为负无穷，远低于区间下限10^{4对应的转换值（log10(10}4)=4），柱形的底部锚点会被直接判定为无效、超出范围，触发整个柱形的过滤，最终所有柱形完全消失。
• 部分柱形非全消失的缺失场景同理：如果某根柱形关联的误差棒端点、柱形顶端超出limits区间，哪怕柱形主体落在区间内，整根柱形也会被直接移除。

不要通过scale层设置纵轴范围，改用坐标层的裁切逻辑完成范围限定。该逻辑不会过滤原始数据、不会触发几何对象剔除，仅将可视区域框定在目标范围内：

• 保留scale_y_continuous(trans = "log10")，仅完成y轴的log10转换
• 移除原有scale层中的limits参数
• 新增coord_cartesian(ylim = c(10^4, 10^7))，通过坐标层实现纯视觉的纵轴范围裁切

修改后的可运行代码：

A = c(1,2,3,4,5,6,7)
B= c(33045, 970250, 1870125, 259625, 3838750, 962333, 2272916.667)
sd = c(8538, 319023, 1538958, 27753, 1602186, 561207, 322322)
df = data.frame(A,B,sd)

ggplot(df, aes(x=A, y=B)) +
    geom_bar(colour="black", stat="identity", fill="grey")  +
    geom_errorbar( aes(x=A, ymin=B-sd, ymax=B+sd), width=0.2, colour="black", alpha=0.9, size=0.5) +
    scale_x_continuous(breaks = 1:7)+
    theme_classic()+
    theme(strip.placement = "outside", 
          axis.text.x = element_text( size = 12 ))+
    scale_y_continuous(trans='log10') +
    coord_cartesian(ylim = c(10^4, 10^7))

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ecg