Ubuntu16.04下自制R包依赖无法从CRAN自动安装的解决问询

首先，你遇到的问题核心在于：当使用install.packages(file.choose(), repos = NULL, type="source")安装本地源码包时，repos = NULL参数会让R跳过从远程仓库（比如CRAN）查找依赖的步骤，所以它不会自动下载缺失的依赖包。要解决这个问题，我们可以分步骤操作，确保所有依赖都从CRAN获取并安装：

步骤1：安装Ubuntu系统层面的依赖库 #

像rgdal、sp这类空间相关的R包需要依赖Ubuntu系统的地理开发库，如果缺少这些库，R包安装会直接失败。打开终端执行以下命令：

sudo apt-get update && sudo apt-get install libgdal-dev libproj-dev libgeos-dev libudunits2-dev

步骤2：从CRAN安装所有R依赖包 #

打开R控制台，执行以下命令来安装DESCRIPTION文件中Imports字段声明的所有依赖包：

install.packages(
  c("jsonlite", "stringr", "MODIStsp", "sp", "maptools", "plyr", "foreign", "rgdal"),
  repos = "https://cloud.r-project.org/"  # 可替换为你常用的CRAN镜像源
)

等待所有依赖包安装完成，如果某个包安装失败，优先检查是否是系统依赖没装全；如果是R版本兼容性问题（你的R是3.4.3，部分较新包可能不再支持该版本），可以从CRAN Archive下载对应版本的源码包手动安装。

步骤3：安装你的自制ModisLST包 #

所有依赖准备完成后，再执行你原来的命令安装自制包：

install.packages(file.choose(), repos = NULL, type="source")

这次就能顺利完成安装了，因为依赖项都已提前就绪。

额外小技巧 #

如果不想每次手动安装依赖，也可以尝试在安装本地包时指定CRAN仓库并开启依赖自动安装（需确保你的包结构符合规范，R能正确解析依赖）：

install.packages(file.choose(), repos = "https://cloud.r-project.org/", type="source", dependencies = TRUE)

不过这种方式偶尔会因为自制包的元数据细节问题导致依赖解析失败，所以提前手动安装依赖是最稳妥的方案。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Piyush Gupta