Cygwin安装bedtools v2.27.0遇zlib.h缺失及libz-dev安装失败求助

嘿，我之前在Cygwin里编译依赖zlib的工具时也踩过这个坑！你找错包名啦——Cygwin里的zlib开发库包名不是libz-dev（那是Ubuntu这类Debian系系统的命名习惯），正确的包名是zlib-devel。

具体解决步骤： #

• 先更新apt-cyg的软件源，确保能找到最新的包信息：

  apt-cyg update
  

• 安装正确的zlib开发包：

  apt-cyg install zlib-devel
  

• 回到bedtools的源码目录，先清理之前编译失败留下的残留文件，再重新编译：

  cd bedtools2
  make clean
  make
  

额外提示： #

如果安装完zlib-devel后还是出现编译错误，可以检查一下是否缺少基础编译工具，比如gcc和make——如果之前没装过的话，一并安装上：

apt-cyg install gcc-core make

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Bisan