别担心，这个问题其实很常见，尤其是刚接触R和Bioconductor包的时候！出现Error in Heatmap(mat) : could not find function "Heatmap"的错误，主要有这几个原因和对应的解决办法：

最可能的原因：未加载ComplexHeatmap包 #

在R语言中，仅仅安装了包是不够的——每次启动新的R会话后，都需要手动加载包才能使用里面的函数。你可以按照以下步骤操作：

1. 先确认包是否已经安装（如果还没安装，先执行这一步）：

   # 如果还没安装BiocManager，先安装它
   install.packages("BiocManager")
   # 安装ComplexHeatmap包
   BiocManager::install("ComplexHeatmap")
   

2. 加载ComplexHeatmap包：

   library(ComplexHeatmap)
   

3. 现在再运行Heatmap(mat)，应该就能正常执行了。

其他可能的原因：拼写错误 #

R语言是大小写敏感的，注意Heatmap的首字母是大写的——基础R里有个小写的heatmap()函数，但这和ComplexHeatmap包的Heatmap()不是同一个东西，别搞混了！

如果按照上面的步骤操作后还是有问题，可以尝试重启R会话，重新安装并加载包，一般就能解决啦。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者ASH