conda环境下pip install报Cython缺失但python setup.py install正常

pip 20.1及以上版本默认启用PEP 517定义的*构建隔离（build isolation）*机制，这是你遇到报错的直接原因：

• 执行pip install .时，pip不会直接在你当前激活的conda环境中运行setup.py，而是会创建一个全新的临时隔离虚拟环境，在这个独立环境中拉取构建所需的依赖、执行打包脚本，最终再把编译好的包安装回正式环境。
• 你此前安装在当前conda环境下的Cython、setuptools等依赖，都属于正式环境的安装内容，临时隔离环境里没有预装对应依赖，就会抛出找不到Cython的模块错误。
• 直接执行python setup.py install时，脚本完全运行在当前激活的conda环境进程中，可以正常读取当前路径下安装的Cython组件，因此流程不会出现报错。

• 临时关闭构建隔离，直接使用当前环境的已有依赖完成安装：执行命令pip install . --no-build-isolation
• 永久配置项目的构建依赖声明：在项目根目录新建pyproject.toml文件，写入固定的构建依赖列表，让pip创建临时隔离环境时自动预装Cython、setuptools、wheel等必须组件，文件参考内容：

[build-system]
requires = ["setuptools>=42", "Cython", "wheel"]
build-backend = "setuptools.build_meta"

• 如果你当前的pip版本没有默认启用PEP 517逻辑，可以强制指定兼容模式执行：pip install . --use-pep517 --no-build-isolation

按照你给出的路径信息，已经可以排除pip和Python环境路径错位的问题：两个可执行文件同属/Users/petioptrv/miniconda3/envs/ib-insync-sim-test/路径下，不存在pip指向其他Python解释器的情况。如果后续遇到类似路径不匹配的问题，优先执行pip -V比对pip对应的Python解释器路径和which python输出的路径是否一致即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Petio Petrov