如何让Bash脚本中三条Python命令按顺序串行执行

关键分隔符差异说明 #

Bash对命令的执行顺序控制，完全由命令之间的分隔符决定，对应行为如下：

• 命令末尾加&：将当前命令放到后台异步运行，不会等待它执行结束就直接启动下一条命令，这是唯一会触发“不等前序结束就跑下一条”的写法
• 命令末尾加;：等待当前命令完全执行退出（无论成功还是报错），再启动下一条命令，这种写法本身就满足你“第二条等第一条完全结束再启动、第三条等第二条完全结束再启动”的基础要求
• 命令之间用&&连接：同样会等待前序命令完全退出才启动下一条，额外增加了状态判断——只有前序命令执行成功（返回退出码0），才会启动下一条命令，适合避免前序步骤出错时，后续无效流程继续运行生成错误结果

适配需求的脚本调整 #

如果你只需要保证命令依次执行，不要求前序失败时中断流程，原脚本不需要任何修改，本身就能正常按顺序运行。
如果你需要更严谨的错误中断逻辑（比如analyze步骤失败了，就不继续跑后续的call、plot步骤），可以把脚本改写为以下形式：

#!/bin/bash

python /path/to/someprogramm.py analyze --probes /path/to/myfile.bed --rpkm_dir /path/to/RPKM/ --output /path/to/hdf5/analysis.hdf5 --write_svals /path/to/SVD/singular_values.txt \
&& python /path/to/someprogramm.py call --input /path/to/hdf5/analysis.hdf5 --output /path/to/calls.txt \
&& python /path/to/someprogramm.py plot --input /path/to/hdf5/analysis.hdf5 --calls /path/to/calls.ng.txt --outputdir /path/to/call_images/ \
&& echo "Command sequence finished successfully"

注意：用反斜杠\做跨行衔接时，要保证反斜杠后面没有任何空格或字符，否则会触发脚本解析错误。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user3224522