使用ggtext调整分面标签字号时x轴标签顺序错乱问题咨询

• 在facet_nested()公式中直接调用big_label_md(Organ)的写法，会将原本为因子类型、自带固定排列顺序的Organ列，转换为无顺序标记的普通字符向量。
• ggplot绘制分面时，对无顺序的普通字符变量会默认按字典序自动重排，这个排序规则和原始数据中定义的因子水平顺序完全不匹配，自然会出现标签错位。
• 仅调整1个标签字号时顺序看似正常，是因为单元素替换带来的字典序偏差刚好和原始顺序部分重合；调整2个及以上标签时，字典序和原始因子顺序的冲突完全显现，就出现了全标签错乱的问题。

1. 不要在分面公式中直接调用会改变变量类型的格式化函数，提前在数据框中完成标签格式化操作，严格保留原因子的顺序属性：

# 提取原Organ因子的原始水平顺序，避免格式转换打乱排列逻辑
original_organ_levels <- levels(data$Organ)
# 批量生成带markdown格式的标签，不改动原有顺序
formatted_organ_levels <- big_label_md(original_organ_levels)
# 生成保留原始顺序的格式化因子
data$Organ_formatted <- factor(
  x = data$Organ,
  levels = original_organ_levels,
  labels = formatted_organ_levels
)

2. 分面绘制时直接使用处理好的格式化因子，替换原来直接在分面公式中调用函数的写法：

ggplot(data = data, aes(Name,mean, label = Name,fill=Organ)) +
  geom_bar(position="dodge2", stat="identity",width = 0.85,color="black") +
  facet_nested(.~Organ_formatted + Disease, 
               scales="free",switch = "x",nest_line = TRUE)+
  theme_classic() +
  theme(legend.text = element_markdown())+
  theme(
    plot.title = element_text(hjust = 0.5),
    plot.margin = unit(c(5, 10, 10, 10), "mm"),
    strip.background = element_rect(colour="black", fill="white"),
    strip.placement = "outside",
    strip.text.x = element_markdown())

• ggplot的分面、坐标排列顺序完全跟随分组变量的类型规则：如果是因子类型，会严格按照因子的levels顺序排列；如果是普通字符类型，就会按字典序自动重排。
• 所有涉及标签格式修改的操作，仅需要修改因子的labels参数即可，完全不需要改动因子的levels顺序，就能在实现自定义字号、颜色效果的同时，彻底避免顺序错乱问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Charité Learner