如何修复R FieldSpectra程序运行时cbind函数的行长度不匹配警告

这个警告出现的本质是你准备合并的两个对象plotnames和m的长度/行数不一致，R的cbind函数遇到长度不等的向量合并时，会把短向量的元素循环重复补齐到和长向量一致的长度，这就是触发警告的原因。这种自动补齐会最终导致你生成的specindices表出现行错位，是完全不可用的，必须修正后再合并。

第一步：先核对两个待合并对象的长度 #

因为m是由多个光谱指数向量合并成的矩阵/数据框，用nrow()查询行数；plotnames是从spectra取出的第一列向量，用length()查询元素总个数，运行以下代码：

# 查看m的总行数
nrow(m)
# 查看plotnames的总元素数
length(plotnames)

两个数值不相等就说明确实是长度不匹配导致的警告。

第二步：定位长度不匹配的具体原因 #

根据核对结果，对应两种常见的场景排查：

• 场景1：m的行数小于plotnames的长度
  这种情况基本是你在计算前面那组光谱指数（CF_690、NDVI等）的过程中，通过过滤、na.omit()等操作删掉了部分无效观测行，但取样方名称的时候还是用了原始全量的spectra[,1]，没有同步匹配过滤后的观测行。
  解决方法：找你之前计算光谱指数时用到的行过滤规则，给plotnames应用完全相同的过滤逻辑。比如你之前算指数时只保留了spectra里第1、2、4、6到最后一行的有效观测，那取样方名就要写：

  plotnames = spectra[c(1,2,4,6:nrow(spectra)), 1]
  

  不能直接取全量的第一列。
• 场景2：plotnames的长度小于m的行数
  这种情况说明组成m的9个光谱指数向量里，有个别向量的长度和其他的不一致，导致最终拼出来的m行数被长的那个向量拉高了。可以运行以下代码挨个核查每个指数向量的长度：

  # 把所有生成的光谱指数放到列表里批量查长度
  check_list = list(CF_690, CF_740, Chl_a_b, NDVI, NDWI, PRI, PRI2, SR, WBI)
  names(check_list) = c("CF_690", "CF_740", "Chl_a_b", "NDVI", "NDWI", "PRI", "PRI2", "SR", "WBI")
  lapply(check_list, length)
  

  找到长度不对的那个向量，回到它的生成代码里排查错误——比如是不是取对应波长的光谱列时索引写错，多取了/漏取了数值，修正到所有指数向量长度一致，再重新生成m。

第三步：重新合并生成最终表 #

等nrow(m)和length(plotnames)的数值完全相等之后，再运行合并代码：

specindices = cbind(plotnames, m)

这时候就不会再出现警告，生成的表格也不会出现行错位的问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者RubiscoActivase