运行Modeller代码触发Python非ASCII语法错误,请求协助排查
错误定位与修复方案
触发原因
报错提示的非ASCII字符\xe2,是代码中混入的中文输入法下输入的全角弯引号的编码值。Python解释器在未声明文件编码时,无法识别这类不在ASCII范围内的字符,直接抛出语法错误。
错误点位
代码中共两处全角引号误用:
- 创建model对象的行:包裹
5ZEO的引号为中文全角弯引号‘’,并非Python语法认可的半角直引号 - 调用
aln.append_model的行:align_codes参数值前面的引号为全角弯引号,和参数末尾的半角单引号格式不匹配
修复操作
- 将上述两处的全角弯引号全部替换为英文半角直单引号
',修改后对应代码段为:
mdl = model(env, file='5ZEO', model_segment=('FIRST:A','LAST:A')) aln.append_model(mdl, align_codes='5ZEOA', atom_files='5ZEO')
- 若使用Python2环境运行脚本,需在脚本最顶部添加编码声明,避免后续其他非ASCII字符触发同类报错,声明代码为:
# -*- coding: utf-8 -*-
内容的提问来源于stack exchange,提问作者JessieJay
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