在R中编译tex文件为PDF时pdflatex.exe运行报错如何解决？

首先明确报错核心原因 #

你遇到的不是R找不到pdflatex的问题：从你输出的PATH可以看到，MiKTeX的bin/x64文件夹已经在系统路径里，R完全可以正常定位到pdflatex.exe。报错是因为手动编译Sweave生成的tex文件时，缺少必要的配置步骤。
之前你修改PATH的操作存在误区：系统PATH环境变量只需要添加可执行文件所在的文件夹路径，不需要写到具体的.exe文件，你之前添加的指向pdflatex.exe本身的路径属于无效配置，直接删掉即可。

可直接执行的解决方案 #

• 第一步：清除无效的PATH配置
  删掉你之前在Renviron.site里添加的错误PATH行，也不需要再运行Sys.setenv加pdflatex文件路径，现有PATH里的C:\Users\vica\AppData\Local\Programs\MiKTeX\miktex\bin\x64\已经足够。
• 第二步：使用R内置工具编译tex文件
  不要手动调用pdflatex，运行以下R代码即可完成编译：

  tools::texi2pdf("exa3.tex", clean = TRUE)
  

  这个函数会自动处理Sweave样式文件路径、多次编译等tex编译必要流程，和你点击knit按钮的底层逻辑一致。
• 可选优化方案：用tinytex包提升编译成功率
  你已经安装了TinyTeX，直接安装对应的R包即可自动处理所有tex依赖问题：

  install.packages("tinytex")
  tinytex::pdflatex("exa3.tex")
  

为什么knit按钮能正常生成PDF #

RStudio的knit按钮会自动执行完整的渲染管线：先处理Rnw文件的代码段生成tex，再自动调用适配的tex编译工具、处理样式依赖、执行多次编译，所以不会出现手动编译的报错。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Vic