如何对Pandas分层列数据绘图及将分层列转为普通单列？

你遇到的报错由两个问题共同导致：

1. plot方法的x/y参数只需要传入列名（分层列对应元组格式的列名），但你直接传入了筛选后的完整DataFrame切片，pandas无法判断DataFrame的布尔值，因此抛出该错误。
2. 代码中"Cerebral Cortex "末尾多了多余空格，和实际的列名不匹配，即使修复第一个问题也会筛选不到对应列。

pivot生成的分层列是MultiIndex结构，每个列的名称是(reg_name, reg_side)格式的元组，直接传入对应元组作为x/y参数即可：

import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt

# 你原有生成分层表的代码
data = {'RID': [1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3, 4, 4, 4, 4, 5, 5, 5, 5], 'Str_dx': ['CN', 'CN', 'CN', 'CN', 'MCI', 'MCI', 'MCI', 'MCI', 'MCI;Dementia', 'MCI;Dementia', 'MCI;Dementia', 'MCI;Dementia', 'CN', 'CN', 'CN', 'CN', 'MCI', 'MCI', 'MCI', 'MCI'], 'reg_name': ['Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex', 'Hippocampus', 'Cerebral Cortex'], 'reg_side': ['left', 'left', 'right', 'right', 'left', 'left', 'right', 'right', 'left', 'left', 'right', 'right', 'left', 'left', 'right', 'right', 'left', 'left', 'right', 'right'], 'gm_vol': [10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19]}
df = pd.DataFrame(data)
tab = pd.pivot_table(df, values='gm_vol', index=['RID', 'Str_dx'], columns=['reg_name', 'reg_side'])

# 绘制散点图，直接传入分层列的元组
tab.plot(kind="scatter", 
         x=('Hippocampus', 'left'), 
         y=('Cerebral Cortex', 'left'), 
         alpha=0.6, 
         c='black')
plt.show()

根据你的使用场景，可以选择两种拉平方式：

方式1：拼接列名为单层级字符串 #

将两层列名用下划线拼接为单个字符串，保留宽表结构：

tab_flat = tab.copy()
# 拼接两层列名
tab_flat.columns = ['_'.join(col) for col in tab.columns]
# 此时列名变为普通单层级：['Hippocampus_left', 'Hippocampus_right', 'Cerebral Cortex_left', 'Cerebral Cortex_right']

# 后续选列直接用字符串即可
tab_flat.plot(kind="scatter", x='Hippocampus_left', y='Cerebral Cortex_left', alpha=0.6, c='black')

方式2：完全拉平为长表格式 #

如果不需要保留宽表结构，直接将所有维度转为普通列，后续筛选、分组操作更灵活：

tab_long = tab.reset_index().melt(id_vars=['RID', 'Str_dx'], value_name='gm_vol')
# 输出后reg_name、reg_side都变为独立的普通列，你可以按需筛选数据

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Al_Mt