嵌套if_else语句异常：仅部分条件生效，Nursery/Other返回NA

看起来你遇到的问题根源在于NA值的处理——当Cultivation Type或Processing Type为NA时，str_detect()会返回NA，而dplyr::if_else()在条件为NA时不会继续执行后续的else分支，直接返回NA，这就导致Nursery和Other的判断根本没机会触发。

我给你两种解决方案，优先推荐第一种，因为case_when()比嵌套if_else更易读，也更容易处理复杂条件：

方案1：用case_when替代嵌套if_else（推荐） #

case_when()会按顺序判断每个条件，而且可以明确处理NA的情况，避免条件返回NA导致的中断：

library(dplyr)
library(stringr)

DF.2 <- DF.1 %>%
  mutate(
    Type = case_when(
      # 匹配Micro：先排除NA，再检测是否包含micro
      (!is.na(`Cultivation Type`) & str_detect(tolower(`Cultivation Type`), "micro")) | 
      (!is.na(`Processing Type`) & str_detect(tolower(`Processing Type`), "micro")) ~ "Micro",
      # 匹配Standard：同理排除NA
      (!is.na(`Cultivation Type`) & str_detect(tolower(`Cultivation Type`), "standard")) | 
      (!is.na(`Processing Type`) & str_detect(tolower(`Processing Type`), "standard")) ~ "Standard",
      # 匹配Nursery：仅检测Cultivation Type，排除NA
      !is.na(`Cultivation Type`) & str_detect(tolower(`Cultivation Type`), "nursery") ~ "Nursery",
      # 所有其他情况（包括所有字段都是NA的情况）
      TRUE ~ "Other"
    )
  )

方案2：修复原有的嵌套if_else #

如果你坚持要用if_else，需要在每个条件里先处理NA，把NA转为FALSE，这样条件就不会返回NA：

DF.2 <- DF.1 %>%
  mutate(
    Type = if_else(
      # 用is.na把NA转为FALSE，确保条件是TRUE/FALSE
      (!is.na(`Cultivation Type`) & str_detect(tolower(`Cultivation Type`), "micro")) | 
      (!is.na(`Processing Type`) & str_detect(tolower(`Processing Type`), "micro")),
      "Micro",
      if_else(
        (!is.na(`Cultivation Type`) & str_detect(tolower(`Cultivation Type`), "standard")) | 
        (!is.na(`Processing Type`) & str_detect(tolower(`Processing Type`), "standard")),
        "Standard",
        if_else(
          !is.na(`Cultivation Type`) & str_detect(tolower(`Cultivation Type`), "nursery"),
          "Nursery",
          "Other"
        )
      )
    )
  )

为什么原来的代码失效？ #

举个例子看第11行数据：Cultivation Type是"Nursery"，Processing Type是NA。原代码的第二个条件是：
str_detect(tolower("Nursery"), "standard") | str_detect(tolower(NA), "standard")
前者是FALSE，后者是NA，所以整个条件结果是FALSE | NA = NA。而if_else()遇到NA的条件时，不会进入else分支，直接返回NA，所以永远到不了判断Nursery的那一步。

用上面的方案处理后，第11行会正确返回"Nursery"，所有全NA的行会返回"Other"。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者SteveM