macOS Big Sur系统下R安装glmnet包报错无法安装如何解决？

核心报错原因 #

• locale 环境变量未配置，触发系统语言设置警告
• 你当前使用的R为x86_64架构的High Sierra build，之前安装的是arm64架构的依赖包，架构不匹配导致gfortran编译报错

修复步骤 #

1. 修复locale配置 #

• 打开系统终端，根据你使用的shell执行对应配置命令：
  • zsh用户执行：

  echo 'export LC_ALL=en_US.UTF-8' >> ~/.zshrc
  echo 'export LANG=en_US.UTF-8' >> ~/.zshrc
  source ~/.zshrc
  

  • bash用户执行：

  echo 'export LC_ALL=en_US.UTF-8' >> ~/.bash_profile
  echo 'export LANG=en_US.UTF-8' >> ~/.bash_profile
  source ~/.bash_profile
  

• 重启R，确认启动时的locale相关警告消失。

2. 安装匹配架构的gfortran #

• 先卸载错误安装的arm64架构pkgconfig，避免后续冲突：
  sudo rm -rf /usr/local/bin/pkg-config /usr/local/share/pkgconfig /usr/local/lib/pkgconfig
• 下载适配x86_64架构R 4.1版本的gfortran安装包，按指引默认路径安装。
• 打开R控制台，执行以下命令配置编译环境变量：

Sys.setenv(PATH = paste("/usr/local/gfortran/bin", Sys.getenv("PATH"), sep=":"))
Sys.setenv(FC = "/usr/local/gfortran/bin/gfortran")
Sys.setenv(F77 = "/usr/local/gfortran/bin/gfortran")

3. 重新安装glmnet包 #

优先安装预编译二进制版本，避免编译报错：
install.packages("glmnet", type = "binary")
如果需要使用源码编译版本，再执行：
install.packages("glmnet", dependencies = TRUE, type = "source")

4. 验证安装 #

执行以下命令，无报错即为安装成功：
library(glmnet) #

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Rafael Gazi