如何批量打开多个R Markdown文件并一次性完成knit操作？

首先确认你已经安装并加载了rmarkdown包，这是Rmd渲染的核心依赖包。

基础批量渲染方案（单目录所有Rmd导出为HTML） #

• 第一步：将R工作目录设置为你存储所有Rmd文件的文件夹，代码为：
  setwd("你的Rmd文件所在文件夹的绝对/相对路径")
• 第二步：提取目录下所有后缀为.Rmd的文件列表：
  rmd_list <- list.files(pattern = "\\.Rmd$", ignore.case = TRUE)
  其中ignore.case = TRUE参数可以同时匹配后缀为小写.rmd的文件，不需要可以移除。
• 第三步：调用函数批量渲染：
  lapply(rmd_list, rmarkdown::render, output_format = "html_document")
  运行上述代码后，所有生成的HTML文件会默认和对应Rmd文件存储在同一目录下。

自定义输出路径方案 #

如果你需要将所有生成的HTML统一存储到指定文件夹（比如./html_output），可以使用以下代码：

# 提前创建输出文件夹，不存在才新建，已存在不会报错
dir.create("html_output", showWarnings = FALSE)
# 批量渲染并指定输出路径
lapply(rmd_list, function(file) {
  rmarkdown::render(
    input = file,
    output_format = "html_document",
    output_dir = "html_output",
    # 保持输出文件名和原Rmd文件名一致
    output_file = paste0(tools::file_path_sans_ext(basename(file)), ".html")
  )
})

若你的Rmd文件设置了自定义参数，可在rmarkdown::render中添加params参数传入对应参数列表即可；如果不同Rmd需要传入不同参数，额外加判断逻辑即可适配。

简化写法 #

如果你已经安装了purrr包，可以用walk函数代替lapply，避免运行后输出多余的列表信息：
purrr::walk(rmd_list, rmarkdown::render, output_format = "html_document")

内容的提问来源于stack exchange，提问作者annie