如何用gtsummary结合Wilcoxon检验做亚组前后比较生成汇总表?
血脂干预研究汇总表构建方案解答
gtsummary实现需求的可行性
完全可以通过gtsummary实现你的分析需求,可同时输出组内Wilcoxon符号秩检验结果、两组间的差异比较统计量。
你可以先将数据整理为每个受试者对应1条记录,包含分组变量、基线胆固醇值、随访胆固醇值、胆固醇变化值三个核心字段,之后通过add_p()或add_difference()函数指定检验方法为Wilcoxon,即可实现以下展示效果:
- 分换药组/持续治疗组展示两个时间点胆固醇的中位数(四分位距)
- 自动输出组内前后比较的Wilcoxon检验P值
- 可自定义添加两组间胆固醇变化值差异比较的统计结果
生成的表格支持直接导出为Word、PDF等格式,符合绝大多数医学期刊的投稿格式要求。
其他常用R汇总表开发包
除gtsummary外,还有多个成熟的R包可用于统计汇总表生成:
flextable:灵活度极高,支持自定义表格的所有样式、合并单元格,可导出为Word、PDF、HTML等多种格式,适合需要高度定制化的论文表格制作gt:RStudio官方推出的表格开发包,语法逻辑清晰,和tidyverse生态兼容性很好,支持多场景的表格样式调整table1:专门用于生成医学研究常用的基线特征表,支持自动添加组间比较P值,语法简单上手快arsenal:内置的tableby()函数可以快速生成分层汇总表,自动匹配对应变量类型的检验方法,适合大样本多变量的批量统计汇总epiDisplay:公共卫生和临床研究常用工具包,生成的汇总表直接符合流行病学期刊的投稿格式要求
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Dmitriy K
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