Cox过程模型聚类规模含义及木材导管点数据适配模型咨询
关于spatstat中Cox过程模型指标含义与模型选择的疑问
我目前在做木材横截面导管分布的研究,发现部分样本里导管明显聚集成簇,打算用R语言spatstat包中的Cox过程模型来拟合这些导管点数据。模型输出里有Mean cluster size(平均聚类规模)和Scale这两个指标,我对它们在我的研究场景中的含义有点拿不准,同时也纠结该选哪类模型更合适,想请教专业的建议:
指标含义的困惑
我看到书中有这样的示例代码:
fitM<-kppm(redwood~1, "MatClust")
fitM
#...
Scale-0.08654
Mean cluster size: 2.525 points
书中作者把Mean cluster size解释为父点扩散产生的子点数量(比如植物幼苗的扩散),但我的研究对象是由形成层细胞发育而来的木质部导管,不存在这种“父点扩散生子点”的过程。我想确认:
- 这个
Mean cluster size能不能理解为全部导管点数据中每个簇的平均导管数量? Scale是不是就是我需要的“聚类尺度”(也就是簇内点的分散程度/簇的空间范围)?
模型选择的疑问
在spatstat提供的NeymanScott、MatCluster、Thomas这些Cox过程模型里,哪一类更适配木质部导管的聚类场景?毕竟导管的形成是形成层细胞分化发育的结果,和一般的扩散型聚集过程不太一样。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Jingming
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