Ubuntu 18.10下安装适配Obspy的pyproj 1.9.5.1遇阻求助

我完全理解你在Ubuntu 18.10上安装Obspy时被pyproj版本兼容问题折腾的挫败感——旧版pyproj和新工具链、系统依赖的冲突确实很棘手。咱们一步步来搞定这个问题：

先清理混乱的残留安装 #

首先得把之前尝试安装留下的冲突包清理干净：

• 卸载已安装的pyproj和Cython：

  pip3 uninstall -y pyproj cython
  

• 修复apt的损坏依赖：

  sudo apt --fix-broken install
  

• 恢复系统默认的libproj版本（之前你尝试升级到6.2.0导致依赖断裂，pyproj 1.9.5.1其实兼容Ubuntu 18.10自带的5.2.0版本）：

  sudo apt install --reinstall libproj-dev
  

安装适配旧版pyproj的Cython版本 #

你遇到的exc_traceback编译错误，是因为新版本Cython生成的代码适配了Python的新线程状态结构，而pyproj 1.9.5.1是基于旧版Cython编写的。咱们安装一个兼容的旧版Cython：

pip3 install cython==0.28.6

重新安装pyproj 1.9.5.1 #

现在用指定的旧版Cython来编译安装pyproj 1.9.5.1，有两种方式可选：

方式一：用pip指定不隔离构建环境 #

让pip使用我们已经安装的旧版Cython，而不是自动下载最新版：

pip3 install pyproj==1.9.5.1 --no-build-isolation

方式二：手动编译源码（更稳妥） #

如果上面的方式还是报错，可以手动编译：

1. 下载pyproj 1.9.5.1的源码包：

   wget https://github.com/pyproj4/pyproj/archive/v1.9.5.1rel.tar.gz
   

2. 解压并进入目录：

   tar xzf v1.9.5.1rel.tar.gz
   cd pyproj-1.9.5.1rel
   

3. 用已安装的Cython编译安装：

   python3 setup.py install
   

最后安装Obspy #

等pyproj 1.9.5.1安装成功后，直接安装Obspy即可：

pip3 install obspy

为什么之前的方法失败？ #

• 直接pip3 install pyproj==1.9.5.1会自动下载最新版Cython，新Cython生成的代码和旧版Python的线程结构不兼容，导致编译错误。
• 从GitHub直接安装的是pyproj的最新版本，它要求libproj≥6.2.0，和Ubuntu 18.10自带的5.2.0冲突。
• Ubuntu 18.10的软件源里没有libproj 6.2.0对应的依赖包，手动安装deb会导致依赖断裂。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Yuki.kuroshita