使用nx.write_gexf保存带属性的networkx图为.gexf文件报错怎么办

• 第一处是低级变量名错误：你代码前半段构造的节点集、边集分别存储在nodes、edges变量中，但后续添加节点调用的是G.add_nodes_from(n)、遍历边用的是for i in e，n和e属于未定义变量。如果你实际运行时已经修正了该错误，那核心问题出在属性值的类型不符合GEXF格式规范。
• 第二处是属性类型不符合要求：nx.write_gexf序列化时仅支持字符串、整数、浮点数、布尔值这类基础单值类型作为节点/边属性，不支持列表、数组等容器类型。你代码中节点的attr值是tolist()生成的列表，边的attr值是套了一层列表的浮点数，序列化时内部逻辑尝试解包属性值，碰到浮点类型的非可迭代对象就会触发对应报错。

将容器类型的属性值转为字符串，或者拆分为多个单值属性即可正常导出，修改后的参考代码如下：

import numpy as np
import networkx as nx

nodes = np.random.rand(3, 5)
edges = np.corrcoef(nodes)

# 节点列表属性转字符串存储
nodes = tuple((i, {'attr': str(nodes[i].tolist())}) for i in range(nodes.shape[0]))
# 边属性去掉外层列表，直接存浮点值
edges = tuple(((i, j), edges[i, j]) for i in range(edges.shape[0]) for j in range(edges.shape[1]))

G = nx.Graph()
G.add_nodes_from(nodes)
for (u, v), weight in edges:
  G.add_edge(u, v, attr=weight)

nx.write_gexf(G, "test.gexf")

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ahmed