R语言结合UpSet图绘制type分布直方图的报错解决咨询

• 你调用的histogram绘图函数底层是ggplot2的geom_histogram()，该函数仅支持对连续数值型变量做分箱统计
• 你的type列是存储SNP/DEL的离散分类变量，不符合geom_histogram()的输入要求，因此触发报错

首先确保已加载依赖包：

library(UpSetR)
library(ggplot2)

有两种常用实现方案：

方案1：自定义ggplot条形图（支持灵活调整样式） #

upset(df, 
      attribute.plots = list(
        gridrows = 50,
        plots = list(
          list(
            plot = function(data) {
              ggplot(data, aes(x = type)) + 
                geom_bar(fill = "#457b9d") +
                labs(x = "变异类型", y = "样本数") +
                theme_minimal()
            },
            x = "type", 
            y = "count"
          )
        )
      ))

方案2：使用UpSetR内置柱状图（写法更简洁） #

upset(df, 
      attribute.plots = list(
        gridrows = 50,
        plots = list(
          list(plot = "hist", x = "type")
        )
      ))

内容的提问来源于stack exchange，提问作者LDT