如何解决ggplot()运行时出现对象/变量缺失的报错问题

错误原因 #

报错是由R的代码解析规则导致：ggplot2图层叠加使用的+运算符不能单独放在新行的开头。R解析代码时，若一行末尾没有未闭合的括号、运算符等标识，会自动判定该行代码执行完毕。你把+放在第二行开头时，第一行的ggplot(ageDF, aes(x = age, y = survival_time))会被作为独立代码尝试执行，没有图层的ggplot对象无法正常渲染，因此触发报错。

修正方案 #

将+放在上一行代码的末尾即可，修正后代码如下：

ageDF = data.frame(cbind(dataset$survival_time, dataset$age))
ageDF = ageDF[complete.cases(ageDF), ]
ggplot(ageDF, aes(x = age, y = survival_time)) +
  geom_point(col = "blue") + 
  geom_smooth(method=lm)

如果你习惯把+放在新行开头，可以用括号包裹整段ggplot代码，R会等待括号内所有代码解析完成后再执行：

ageDF = data.frame(cbind(dataset$survival_time, dataset$age))
ageDF = ageDF[complete.cases(ageDF), ]
(
ggplot(ageDF, aes(x = age, y = survival_time))
+ geom_point(col = "blue") 
+ geom_smooth(method=lm)
)

可选优化 #

你现有的数据处理代码可以简化，以下代码和你原来的两行数据处理代码效果完全一致，写法更简洁：

ageDF <- na.omit(data.frame(
  survival_time = dataset$survival_time,
  age = dataset$age
))

内容的提问来源于stack exchange，提问作者user15300490