如何从Jupyter Notebook A运行Notebook B并保存其输出结果？

方案一：参数化运行工具papermill（推荐，完全符合需求） #

无需修改Notebook B的业务逻辑，也不需要额外加保存函数，自带运行完成自动保存能力：

• 先安装依赖：pip install papermill
• 给Notebook B添加参数接收单元格：打开B，新建一个单元格放在最开头，给该单元格打上parameters标签（Jupyter Lab在右侧属性面板的「单元格标签」处添加，Jupyter Notebook经典界面在「视图 → 单元格工具栏 → 标签」开启后添加），单元格内仅需要定义参数的默认值即可，示例：

# 本单元格已打parameters标签
user_id = "default"
data_df = None
start_time = "2024-01-01"

• 在Notebook A中执行以下代码，即可将A中的变量传递给B、按顺序完整运行B、自动保存运行后的B文件：

import papermill as pm

pm.execute_notebook(
    input_path="./notebook_b.ipynb", # 你的B文件路径
    output_path="./notebook_b.ipynb", # 运行后保存的路径，可自定义，不想覆盖原文件可改名为其他
    parameters={
        "user_id": current_user_id, # current_user_id是A中已定义的变量
        "data_df": a_calculated_df, # A中计算好的DataFrame也可直接传递
        "start_time": query_start
    }
)

方案二：内置%run魔术命令（无额外依赖） #

不需要安装第三方包，适合轻量场景：

• 直接在Notebook A的单元格中运行：%run ./notebook_b.ipynb
• 运行后A内核中的所有变量会自动共享给B，B会按原有顺序自上而下全部运行
• 注意：该方法默认不会自动保存B的运行结果到本地ipynb文件，若需要自动保存，仅需在B的最后一个单元格添加以下代码即可：

from IPython.display import Javascript
import time
# 等待所有输出渲染完成后自动保存
time.sleep(3)
display(Javascript('IPython.notebook.save_checkpoint();'))

HTML导出说明 #

你当前使用的jupyter nbconvert notebook_b.ipynb --no-input --no-prompt --to html命令可以直接复用，等B运行保存完成后执行即可得到无代码、无输入提示的纯分析结果HTML文件，适合非技术人员查看。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Adler Müller