如何使用Conda为指定版本Python（如3.4）安装依赖包？

操作步骤 #

• 第一步：创建指定Python版本的独立虚拟环境
  执行以下命令创建Python3.4专属的conda环境，环境名可自定义，此处以py34_env为例：

  conda create -n py34_env python=3.4
  

  执行过程中出现确认提示时输入y回车即可完成环境创建。

• 第二步：激活虚拟环境
  Linux环境下执行激活命令：

  source activate py34_env
  

  若使用的是4.6及以上版本的conda，也可使用：

  conda activate py34_env
  

  激活成功后，终端命令行前缀会出现(py34_env)标识，代表当前所有操作都在该虚拟环境内生效。

• 第三步：安装适配的依赖包
  激活环境后直接执行plastid安装命令，conda会自动匹配适配Python3.4的plastid版本进行安装，不需要额外指定版本，也不会触发系统级权限请求（虚拟环境所有文件都存储在当前用户的个人目录下，规避服务器权限限制）：

  conda install -c bioconda plastid
  

  如果安装时提示依赖缺失，可先添加conda-forge源后再重试安装：

  conda config --add channels conda-forge
  conda install -c bioconda plastid
  

• 第四步：验证安装结果
  依次执行以下命令验证环境和依赖是否符合要求：

  1. 确认Python版本为3.4.x：
     python --version
  2. 确认plastid可正常导入：
     python -c "import plastid; print(plastid.__version__)"
     无报错即为安装成功，后续运行ORF-rater前，先激活该虚拟环境即可正常运行。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者elielink