R包TwoSampleMR执行harmonise_data()行数不一致报错原因咨询

报错触发原因 #

• 核心触发原因：p值列名不匹配
  代码中read_outcome_data的pval_col参数填写的'Р-value'首字母为西里尔字母Р，与结局GWAS文件表头的英文大写P字符编码不一致，无法匹配到正确的p值列。部分SNP行因p值读取为缺失值，被函数默认过滤逻辑剔除，导致读取到的out_dat对应行数为0，和暴露数据的1行做匹配合并时就会触发行数不一致的报错。
  直接将该参数修改为pval_col = 'P-value'（使用英文大写P输入）即可解决该问题。
• 参数拼写错误
  调用harmonise_data时填写的参数名exporsure_dat为错误拼写，正确参数名为exposure_dat，拼写错误会导致函数无法正确识别传入的暴露数据，也可能引发数据匹配异常。
• 补充核对项
  你提供的代码中filename参数行末尾缺少逗号，属于语法错误，如果实际运行时没有直接报语法错误，大概率是粘贴代码时的笔误，建议核对本地代码的参数分隔符是否正确。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Margobel