如何在ggplot中平滑密度图整数取值间的异常谷值
离散整数尺度叠加密度图谷值平滑方案
你遇到的谷值是geom_density默认的连续核密度计算逻辑导致的:1-7的整数取值之间没有实际观测,默认的窄带宽会直接把无数据区间识别为低密度区,生成不符合预期的谷值。可以通过以下两种方案解决:
方案1:调整密度计算的平滑参数(最便捷)
修改geom_density的adjust参数(带宽乘数,数值越大平滑程度越高),或直接指定bw(带宽值)即可抹平相邻整数间的谷值。对于步长为1的1-7分数据,adjust设置为1.2~2之间即可得到平滑效果,修改后的代码示例:ggplot(dface, aes(Current.Mood, fill = NewCode)) + geom_density(alpha = 0.1, adjust = 1.5)该方案不需要改动原始数据,仅调整密度计算逻辑即可,保留了叠加密度图的原有展示形式。
方案2:基于离散频率生成平滑面积图(完全贴合离散数据)
如果希望彻底避免无数据区间的不合理数值,可以先统计每个分组下各得分的频率,再基于频率做平滑拟合后绘制叠加面积图,示例代码如下:library(tidyverse) # 先按分组统计各得分的频率 freq_df <- dface %>% count(NewCode, Current.Mood) %>% group_by(NewCode) %>% mutate(freq = n / sum(n)) # 绘制平滑叠加面积图 ggplot(freq_df, aes(x = Current.Mood, fill = NewCode)) + stat_smooth(aes(y = freq, color = NewCode), geom = "area", alpha = 0.1, se = FALSE, span = 0.8)该方案的输出完全基于你的实际观测值分布,不会出现无意义的谷值。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者AnonymousCoward
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